DOT1L调控NK细胞活化与谱系完整性的ChIP-seq数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE222323

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数据说明

表观遗传修饰剂是改善癌症患者治疗的有前景的靶点。用小分子抑制剂靶向甲基转移酶DOT1L已显示出对控制癌细胞有良好效果。然而，这些小分子是全身给药的，可能对非癌细胞（如免疫系统细胞）产生深远影响。在先天免疫系统中，自然杀伤（NK）细胞是一个关键亚群，在控制转化细胞和肿瘤炎症中发挥重要作用。既往研究表明，NK细胞在富含TGFβ的肿瘤微环境（TME）中可转化为ILC1样细胞。此外，急性髓系白血病（AML）或慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者外周血单个核细胞（PBMCs）中ILC1细胞频率增加，这些细胞促炎细胞因子产生减少、颗粒酶B产生降低。在本研究中，我们确定DOT1L是NK细胞活化和谱系完整性的关键调控因子。

我们构建了NKp46条件性DOT1L敲除小鼠（DOT1L.Ncr1），并观察到这些小鼠中ILC1样细胞（CD49b+ CD49a+、CD62L-）频率增加，而NK细胞（CD49b+ CD49a-、CD62L+）频率降低。虽然DOT1L缺失增加了对TGFβ的敏感性，但CD49a表达升高具有高度内在性，且仅部分依赖于TGFβ信号传导。在功能上，DOT1L.Ncr1小鼠肿瘤微环境中ILC1样细胞增多导致肿瘤控制能力下降。我们对转录程序的评估揭示了转录因子的替代性使用，例如AP-1家族或SMAD2/3，以维持NK细胞活化和谱系完整性。我们的发现为DOT1L在NK细胞生物学中此前未知的作用提供了证据，并证明了维持NK细胞谱系完整性对于有效控制肿瘤的重要性。这些发现对去

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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