急性髓系白血病干样癌细胞药物敏感性解卷积单细胞RNA测序数据集
该数据集来自NCBI GEO，标题为GSE217922，聚焦急性髓系白血病（AML）中干样癌细胞的药物敏感性。源站描述指出，离体药物敏感性筛查（DSS）仅提供混合细胞读数，可能掩盖临床相关细胞亚型的信息；研究者开发了机器学习框架，将bulk RNA表达与bulk药物敏感性匹配，解卷积为细胞亚型组成及
![GSE217922: Deconvolution of drug screening data delineates drug sensitivity of stem-like cancer cells in Acute Myeloid Leukemia [scRNA-Seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/137222.jpg)
基本信息
资源简介
急性髓系白血病干样癌细胞药物敏感性解卷积单细胞RNA测序数据集
Deconvolution of drug screening data delineates drug sensitivity of stem-like cancer cells in Acute Myeloid Leukemia [scRNA-Seq]
该数据集来自NCBI GEO，标题为GSE217922，聚焦急性髓系白血病（AML）中干样癌细胞的药物敏感性。数据为单细胞RNA测序（scRNA-Seq）表达谱，包含1个文件（GSE217922_series_matrix.txt.gz），物种为人（9606），平台为GPL20301。源站描述指出，离体药物敏感性筛查（DSS）仅提供混合细胞读数，可能掩盖临床相关细胞亚型的信息；研究者开发了机器学习框架，将bulk RNA表达与bulk药物敏感性匹配，解卷积为细胞亚型组成及细胞亚型药物敏感性。该数据可用于研究AML干细胞样亚群的药物反应预测（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Nov 14 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：离体药物敏感性筛查（DSS）仅提供混合细胞的读数，可能掩盖关于临床相关细胞亚型的重要信息。在此，我们开发了一个机器学习框架，将bulk RNA表达与bulk药物敏感性匹配，解卷积为细胞亚型组成和细胞亚型药物敏感性。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL20301、9606。本站分类：肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE217922
【使用注意】
· 源站最后修改于 Nov 19 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE217922
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
离体药物敏感性筛查（DSS）仅能提供细胞混合物的读数，可能掩盖关于临床相关细胞亚型的重要信息。在此，我们开发了一个机器学习框架，将批量RNA表达与批量药物敏感性相匹配，解卷积为细胞亚型组成和细胞亚型药物敏感性。我们首先确定，我们的方法比当前最先进的方法能更准确地解析批量样本的细胞组成。然后，我们优化了一种能够估计细胞亚型和单细胞特异性药物敏感性的算法，并通过进行体外药物研究对其进行了评估。
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