GSE212430:环状RNA依然存在——MLL重组组视角

数据基于高通量测序表达谱,涉及MLL重排急性白血病中环状RNA的研究,覆盖MLL及多数MLL易位伴侣基因表达的circRNAs,可用于探索circRNAs在白血病发生中的表达特征与潜在调控作用(来源 NCBI)

geo
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基因组分类GPL111549606
GSE212430: CircRNAs Are Here to Stay: A Perspective on the MLL Recombinome

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

GSE212430:环状RNA依然存在——MLL重组组视角

CircRNAs Are Here to Stay: A Perspective on the MLL Recombinome

该数据集来自NCBI GEO,标题为CircRNAs Are Here to Stay: A Perspective on the MLL Recombinome,属于肿瘤/白血病分类,包含1个文件GSE212430_series_matrix.txt.gz。数据基于高通量测序表达谱,涉及MLL重排急性白血病中环状RNA的研究,覆盖MLL及多数MLL易位伴侣基因表达的circRNAs,可用于探索circRNAs在白血病发生中的表达特征与潜在调控作用(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 31 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):癌症基因组携带的染色体易位是重要的致癌驱动因素。在MLL重排的急性白血病(MLLre)中,MLL/KMT2A与超过90个伴侣基因融合。机制研究为MLL融合蛋白的白血病生成潜力提供了线索,但模型未能完全重现该疾病。最近,MLL-AF9融合表达致癌融合环状RNA(f-circ)已被证实。这一发现,连同关于circRNAs重要性和多样性的新兴数据,构成了研究MLL重组组circRNAs的动机。通过与其他RNA(如microRNAs)和蛋白质的相互作用,circRNAs调控与癌症发展相关的细胞过程。CircRNAs也可以翻译成功能性肽。MLL和大多数90个MLL易位伴侣确实表达circRNAs,并且对我们分选血细胞群体的RNA-seq数据集的探索p

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL11154、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE212430

【使用注意】

· 源站最后修改于 Mar 13 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE212430

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

癌症基因组中的染色体易位是重要的致癌驱动因素。在MLL重排的急性白血病(MLLre)中,MLL/KMT2A与超过90个伙伴基因发生融合。机制研究为MLL融合蛋白的白血病生成潜能提供了线索,但模型未能完全重现该疾病。近期,MLL-AF9融合表达致癌性融合环状RNA(f-circ)已被证实。这一发现,连同关于circRNA重要性和多样性的新兴数据,构成了研究MLL重组体circRNA的动因。通过与其他RNA(如microRNA)及蛋白质的相互作用,circRNA调控与癌症发展相关的细胞过程。CircRNA也可翻译为功能性肽。MLL及90个MLL易位伙伴中的大多数确实表达circRNA,而对我们分选血细胞群体RNA-seq数据集的探索,为MLL重组体circRNA的可变环状异构体生成及表达变异性提供了新数据。

此外,我们提供了证据表明,MLL的重排及其三个主要易位伙伴基因能够影响circRNA的表达,这一发现也得到了白血病细胞初步观察结果的支持。这一新兴的图景支持了在研究MLL重排白血病时circRNAs值得考虑的观点,并为染色体易位对癌细胞广泛影响提供了新的视角。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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