Tristetraprolin限制年龄相关髓源性抑制细胞扩增
该数据集来自 NCBI GEO(GSE210910),主题为 Tristetraprolin(TTP)对年龄相关髓系细胞扩增的限制作用,属于肿瘤/白血病相关表达谱研究

基本信息
资源简介
Tristetraprolin限制年龄相关髓源性抑制细胞扩增
Tristetraprolin Limits Age-related Expansion of Myeloid-Derived Suppressor Cells
该数据集来自 NCBI GEO(GSE210910),主题为 Tristetraprolin(TTP)对年龄相关髓系细胞扩增的限制作用,属于肿瘤/白血病相关表达谱研究。数据采用高通量测序进行表达谱分析,平台为 GPL24247,物种为小鼠(10090),共包含 1 个文件(GSE210910_series_matrix.txt.gz)。数据可用于研究 TTP 缺失或敲入背景下髓源性抑制细胞(MDSC)亚群及巨噬细胞的表达变化,为年龄相关髓系增生和白血病风险机制分析提供转录组层面的支持(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Aug 10 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):衰老导致髓系生成增强,这与髓系白血病患病率增加以及髓源性抑制细胞(MDSC)的产生相关。Tristetraprolin(TTP)是一种 RNA 结合蛋白,通过使靶 mRNA 去稳定化来调控免疫相关细胞因子和趋化因子。由于已知髓系细胞中 TTP 表达随年龄下降,我们使用 TTP 缺陷(TTPKO)小鼠模拟老年小鼠,以研究 TTP 在年龄相关髓系生成中的调控作用。TTPKO 和髓系特异性 TTPKO(cTTPKO)小鼠的脾脏和肠系膜淋巴结中,MDSC 两个亚群 M-MDSC(CD11b+Ly6ChiLy6G-)和 PMN-MDSC(CD11b+Ly6CloLy6G+)以及巨噬细胞(CD11b+F4/80+)均显著增加;然而,骨髓中未观察到 MDSC 的数量变化。相比之下,功能获得性 TTP 敲入(TTPKI)小鼠的 MDSC 与 co
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE210910
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 27 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
衰老会导致髓系造血增强,这与髓系白血病患病率增加以及髓源性抑制细胞(MDSCs)的产生相关。三聚四脯氨酸(TTP)是一种RNA结合蛋白,通过使靶mRNA去稳定化来调控免疫相关细胞因子和趋化因子。由于已知髓系细胞中TTP表达随年龄增长而下降,我们使用TTP缺陷(TTPKO)小鼠模拟老年小鼠,以研究TTP在年龄相关髓系造血中的调控作用。TTPKO和髓系特异性TTPKO(cTTPKO)小鼠脾脏和肠系膜淋巴结中MDSC亚群M-MDSCs(CD11b+Ly6ChiLy6G-)和PMN-MDSCs(CD11b+Ly6CloLy6G+)以及巨噬细胞(CD11b+F4/80+)均显著增加;然而,骨髓中MDSCs未见数量变化。相反,功能获得性TTP敲入(TTPKI)小鼠与对照小鼠相比MDSCs无变化。在骨髓内,总粒细胞-单核细胞祖细胞(GMPs)和单核细胞祖细胞(MPs)——M-MDSCs的直接前体——在cTTPKO和TTPKO小鼠中均显著增加,但粒细胞祖细胞(GPs)仅在TTPKO小鼠中显著增加。
骨髓髓系细胞群体的转录组分析显示,在cTTPKO和TTPKO小鼠中,CC趋化因子受体2(CCR2)的表达显著增加,该受体在单核细胞向炎症部位动员中发挥关键作用。同时,作为CCR2的主要配体,CC趋化因子配体2(CCL2)在cTTPKO和TTPKO小鼠血清中浓度较高,提示TTP通过调控CCR2-CCL2轴影响衰老过程中M-MDSC从骨髓向炎症部位的动员。总体而言,这些研究揭示了TTP在调控年龄相关髓系生成中的先前未被认识的作用,即通过特定髓系祖细胞和M-MDSC的扩增及其向损伤、炎症或其他病理部位的募集来实现。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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