THP-1细胞系：THP-1细胞分类参考数据（表达谱）

资源简介

THP-1细胞系：THP-1细胞分类参考数据（表达谱）

GSE178444 是一份面向 THP-1 细胞系分类研究的表达谱参考数据集，由 Fumio、Kasai 提交，发布于 2021 年 6 月 18 日，来源为美国国家生物技术信息中心（NCBI）。THP-1 是代表性的白血病细胞系，自 1980 年在日本建立以来在全球范围内被广泛使用。该数据集以基因表达谱数据的形式，为 THP-1 细胞的分类研究提供参考依据，属于肿瘤／白血病方向的数据资源。数据集共包含 1 个文件，即 GSE178444_series_matrix.txt.gz，采用 GZIP 压缩格式，便于下载与本地读取。整体而言，该数据集规模精简、主题明确，适合作为 THP-1 细胞表达谱分析与分类方法验证的参考数据。

【数据集背景】

THP-1 是一种代表性的白血病细胞系，自 1980 年在日本建立以来，已在世界范围内得到广泛使用，是白血病相关研究中常见的体外模型之一。围绕该细胞系开展表达谱层面的分类研究，需要有可靠的参考数据作为比对基础。GSE178444 正是在这一背景下产生的数据集，其英文全称为“THP-1 cell lines: reference data for classification of THP-1 cells (expression)”，中文含义为 THP-1 细胞系分类参考数据（表达谱部分），主题标签为表达谱芯片分析（Expression profiling by array），平台编号为 GPL24539，物种编号为 9606（即人类）。该数据集在分类上归入肿瘤／白血病方向，与 THP-1 作为白血病细胞系的定位一致。

【数据内容】

该数据集共包含 1 个数据文件，文件名为 GSE178444_series_matrix.txt.gz，为 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件。此类文件通常以矩阵形式组织样本与表达值信息，是表达谱芯片数据常见的分发形式。数据集的英文标题与源站标题一致，均为“THP-1 cell lines: reference data for classification of THP-1 cells (expression)”，表明其内容聚焦于 THP-1 细胞的表达谱参考数据，服务于细胞分类研究。除上述文件信息外，源站未提供更细的样本数量、探针数量或具体分组说明。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），由 Fumio、Kasai 提交，发布时间为 2021 年 6 月 18 日。数据以表达谱芯片（Expression profiling by array）方式产生，关联平台为 GPL24539，物种为人类（9606）。源站描述指出，THP-1 是代表性的白血病细胞系，自 1980 年在日本建立以来被全球广泛使用，这构成了该参考数据集的研究背景。关于具体的样本采集流程、实验处理条件与建库细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于 THP-1 细胞的分类研究，为相关表达谱分析提供参考。具体而言，可作为表达谱比对与分类方法验证的参考数据，用于考察 THP-1 细胞在表达层面的特征；也可作为白血病细胞系研究中的辅助参考资源。由于其定位为“参考数据”，适合在开展 THP-1 相关表达谱分析时用作对照或基准。关于该数据集在其他类型研究中的适用性，源站未提供。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE178444_series_matrix.txt.gz，该文件为 GZIP 压缩包，需按相应格式解压后读取。建议先在小样本上核对字段结构与编码方式，确认无误后再进行批量接入，以避免因格式或编码问题导致解析错误。读取后可按系列矩阵的常规组织方式提取样本信息与表达值，用于后续的分类或比对分析。关于具体的分析流程与参数设置，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件，规模较为精简，适合作为参考数据使用。其数据产生方式为表达谱芯片，平台编号为 GPL24539，物种为人类。关于数据的样本量、重复数、质控指标与批次信息，源站未提供，因此在使用前应自行核对数据完整性与字段一致性。此外，该数据集定位为 THP-1 细胞分类的参考数据，其适用范围可能受限于该细胞系与相应平台，外推到其他细胞类型或其他平台时需谨慎。关于许可条款与使用限制，源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Fumio、Kasai，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，发布时间为 2021 年 6 月 18 日。使用时应注明数据来源与数据集编号 GSE178444。关于具体的引用格式、许可类型与再分发条件，源站未提供。