ISRIB联合伊马替尼靶向整合应激反应削弱STAT5信号并清除耐药慢性髓性白血病细胞

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE171853

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

整合应激反应（ISR）通过重编程细胞应答，促进细胞适应多变的环境条件。已有报道称ISR在神经系统疾病和实体瘤中被激活，但其在血液系统恶性肿瘤中的功能仍 largely 未知。此前我们已证明ISR在慢性髓性白血病（CML）CD34+细胞中被激活，且其活性与疾病进展和伊马替尼耐药相关。在此我们证明，用小分子ISRIB（而非PERK抑制剂GSK2656157）抑制ISR可恢复对伊马替尼的敏感性并清除CML-BP CD34+耐药细胞。我们发现在携带PTPN11功能获得性突变、对伊马替尼/达沙替尼耐药的CML原始细胞CD34+的PDX小鼠模型中，伊马替尼与ISRIB联合使用可降低白血病植入。此外，联合处理后与SGK3、RAS/RAF/MAPK、JAK2和IFNγ通路相关的基因表达下调。值得注意的是，我们证实ISRIB与伊马替尼联合可降低STAT5磷酸化，并抑制负责增殖、存活和应激反应的STAT5靶基因的表达。

因此，我们的数据表明伊马替尼与ISRIB联合使用具有显著效应，可导致转录组失调并清除伊马替尼耐药细胞。我们的发现提示，这种药物组合可能改善表现出组成性STAT5激活的TKI耐药白血病患者的治疗结果。该数据集的生成由波兰国家科学中心OPUS基金（2021/41/B/NZ5/04077）资助，资助对象为Katarzyna Piwocka。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。