Torque Teno Mini Virus 致缺乏 PML/RARA 融合的儿童急性早幼粒细胞白血病
源站描述了一例儿童复发性 PML/RARA 阴性急性早幼粒细胞白血病(APL)病例,经全反式维甲酸(ATRA)联合三氧化二砷(ATO)及后续 HSCT 救治;证据显示 Torque Teno Mini Virus 序列整合入 RARA 内含子 2,产生框内 TTMV/RARA 嵌合融合转录本,在诊断

基本信息
资源简介
Torque Teno Mini Virus 致缺乏 PML/RARA 融合的儿童急性早幼粒细胞白血病
Torque Teno Mini Virus as a cause of childhood acute promyelocytic leukemia lacking PML/RARA fusion
该数据集来自 NCBI GEO,包含 1 个文件(GSE169521_series_matrix.txt.gz),主题为高通量测序表达谱分析。源站描述了一例儿童复发性 PML/RARA 阴性急性早幼粒细胞白血病(APL)病例,经全反式维甲酸(ATRA)联合三氧化二砷(ATO)及后续 HSCT 救治;证据显示 Torque Teno Mini Virus 序列整合入 RARA 内含子 2,产生框内 TTMV/RARA 嵌合融合转录本,在诊断和复发时高表达、缓解时完全清除。数据可用于研究该融合事件及 APL 相关表达特征(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Mar 24 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们描述了一例儿童复发性 PML/RARA 阴性急性早幼粒细胞白血病(APL)病例,经全反式维甲酸(ATRA)联合三氧化二砷(ATO)及后续 HSCT 救治。我们提供证据表明,存在一种嵌合病毒转录本,其通过将 Torque Teno Mini Virus 序列基因组整合入 RARA 内含子 2(APL 中所有嵌合 RARA 融合所见的复发性断点)而产生。这产生了一个框内 TTMV/RARA 嵌合融合,该融合在疾病诊断和复发时高表达,并在达到缓解时完全清除。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL15456、9606。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE169521
【使用注意】
· 源站最后修改于 Dec 03 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE169521
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们描述了一例复发型PML/RARA阴性急性早幼粒细胞白血病(APL)患儿,经全反式维甲酸(ATRA)与三氧化二砷(ATO)联合治疗后获得挽救,随后接受了HSCT。我们提供了证据,证明存在一种嵌合病毒转录本,该转录本由Torque Teno Mini Virus序列基因组整合至RARA内含子2而产生,而RARA内含子2正是APL中所有嵌合RARA融合所涉及的复发性断裂点。这产生了一个框内TTMV/RARA嵌合融合,该融合在疾病诊断和复发时高表达,并在达到缓解后完全清除。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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