AMD3100与G-CSF动员不同CD34+细胞群体的基因与miRNA表达数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE16936

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

普乐沙福（AMD3100）和G-CSF通过不同机制动员外周血干细胞（PBSCs）。研究采用恒河猴模型，比较普乐沙福和G-CSF动员的CD34+细胞。从3只接受G-CSF、普乐沙福或普乐沙福联合G-CSF治疗的恒河猴中采集了3份PBSC浓缩物。通过免疫选择分离CD34+细胞，并采用全基因和微小RNA（miR）表达微阵列进行分析。基因表达数据的无监督层次聚类根据动员方案将CD34+细胞分为三组。普乐沙福动员的细胞富集B细胞、T细胞和肥大细胞基因，而G-CSF动员的细胞富集中性粒细胞和单核吞噬细胞（MPs）基因。在普乐沙福联合G-CSF动员的CD34+细胞中上调的基因包括许多单独使用任一药物均未上调的基因。两种造血祖细胞miR，miR-10和miR-126，以及一种树突状细胞miR，miR-155，在G-CSF动员的CD34+细胞中上调。一种前B细胞急性淋巴细胞白血病miR，miR-143-3p，和一种T细胞miR，miR-143-5p，在普乐沙福联合G-CSF动员的细胞中上调。

CD34+细胞的组成取决于动员方案。Plerixafor动员的CD34+细胞包含更多B细胞、T细胞和肥大细胞前体，而G-CSF动员的细胞则含有更多中性粒细胞和MP前体。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。