GSE16413：基因敲低研究揭示CCDC50为套细胞淋巴瘤和慢性淋巴细胞白血病候选基因

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE16413

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

两种B细胞非霍奇金淋巴瘤（NHL）实体——慢性淋巴细胞白血病（CLL）和套细胞淋巴瘤（MCL）——显示出反复出现的染色体3q25-q29、12q13-q14和18q21-q22获得。这些畸变所影响的病理机制尚不清楚。本研究的目的是识别位于这些获得区域内的基因，这些基因控制MCL和CLL癌细胞的细胞死亡和细胞存活。通过基因表达谱分析，对来自24例CLL和6例MCL患者的血液样本以及代表这两种恶性肿瘤的6个细胞系进行了分析。通过比较基因组DNA和基因表达，识别出72个候选基因。我们针对这些候选基因进行了有限的RNAi筛选，以识别影响细胞存活的基因。CCDC50、SERPINI2和SMARCC2介导了原代CLL细胞以及细胞系中细胞活力的降低。基因敲低和NFkB报告基因检测揭示，CCDC50是MCL和CLL细胞存活所必需的，并控制NFkB信号传导。本SuperSeries由下列SubSeries组成。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。