GSE15621:急性淋巴细胞白血病与相关异种移植瘤比较

该数据集来自 NCBI GEO,比较急性淋巴细胞白血病患者样本与相应小鼠异种移植瘤的基因表达谱。样本取自 6 例急性淋巴细胞白血病患者的外周血或骨髓,用于生成小鼠异种移植瘤,并对两种样本来源进行比较

geo
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基因组分类Expression profiling by arrayGPL68849606
GSE15621: Acute Lymphocytic Leukemia versus associated xenografts

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

GSE15621:急性淋巴细胞白血病与相关异种移植瘤比较

GSE15621 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达谱数据集,主题为急性淋巴细胞白血病与相应小鼠异种移植瘤之间的比较。数据集收录了来自 6 例急性淋巴细胞白血病患者的白血病细胞样本,这些细胞取自外周血或骨髓,并被用于生成小鼠异种移植瘤,研究对这两种样本来源进行了比较。数据集归属于肿瘤/白血病分类,采用表达谱芯片技术,包含 1 个数据文件,样例文件为 GSE15621_series_matrix.txt.gz,作者为 Sean Davis,发布时间为 Apr 09 200。该数据集可用于考察患者原代白血病细胞与其小鼠异种移植模型之间基因表达谱的异同。

【数据集背景】

急性淋巴细胞白血病是血液系统恶性肿瘤,患者来源的白血病细胞常被移植到免疫缺陷小鼠体内以建立异种移植模型,用于疾病机制研究与药物评价。该数据集正是围绕这一研究场景构建:将 6 例急性淋巴细胞白血病患者的外周血或骨髓来源白血病细胞用于生成小鼠异种移植瘤,并对患者样本与相应异种移植瘤之间的基因表达谱进行比较,以刻画两类样本来源的关系。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE15621_series_matrix.txt.gz,属于表达谱芯片数据。主题标签包括 Expression profiling by array、GPL6884 与 9606,分别指向芯片表达谱平台、芯片平台编号以及人类物种信息。数据内容的核心是比较急性淋巴细胞白血病患者样本与由这些细胞生成的小鼠异种移植瘤的基因表达谱。

【采集与来源】

样本来自 6 例急性淋巴细胞白血病患者,白血病细胞取自外周血或骨髓。这些细胞被用于生成小鼠异种移植瘤,研究对患者来源样本与异种移植瘤两种样本来源进行比较。数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 NCBI GEO 收录的数据集,源站标题为 Acute Lymphocytic Leukemia versus associated xenografts。

【适用场景】

该数据集适用于白血病异种移植模型相关的研究场景,例如评估患者原代白血病细胞与小鼠异种移植瘤在基因表达层面的可比性,考察不同样本来源(外周血与骨髓)对表达谱的影响,以及为基于异种移植模型的后续研究提供表达谱参考。其表达谱芯片数据形式也适合用于基因表达层面的比较分析。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE15621_series_matrix.txt.gz,该文件为 GZIP 压缩包格式。建议先按文件格式读取,在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入分析流程。由于数据集仅含 1 个文件,读取与校验流程相对简单,但仍应先完成小样本核对再开展整体分析。

【质量与限制】

源站未提供关于样本量以外的质量评估、数据完整性或技术偏倚等信息。已知样本涉及 6 例患者,样本来源为外周血或骨髓,具体每例样本的来源分布、芯片实验细节及数据处理方式源站未提供。使用时应结合源站原始记录核实相关细节。

【引用与许可】

作者为 Sean Davis,发布时间为 Apr 09 200。数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于引用格式与使用许可的具体条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE15621

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

从6名急性淋巴细胞白血病患者的外周血或骨髓中获取了白血病细胞。这些细胞被用于生成小鼠异种移植模型,并对这两种样本来源进行了比较。

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