长链非编码RNA类固醇受体RNA激活因子在人红系母细胞中的全基因组转录调控

该数据集来自 NCBI GEO(GSE151926),研究长链非编码 RNA SRA 在人红白血病细胞系 K562 与原代红系母细胞中的全基因组转录调控作用

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基因组预测GPL167919606
GSE151926: Genome-wide transcriptional regulation of the long non-coding RNA steroid receptor RNA activator in human erythroblasts

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

长链非编码RNA类固醇受体RNA激活因子在人红系母细胞中的全基因组转录调控

Genome-wide transcriptional regulation of the long non-coding RNA steroid receptor RNA activator in human erythroblasts

该数据集来自 NCBI GEO(GSE151926),研究长链非编码 RNA SRA 在人红白血病细胞系 K562 与原代红系母细胞中的全基因组转录调控作用。数据通过高通量测序进行表达谱分析,包含 1 个文件(GSE151926_series_matrix.txt.gz),物种为人(9606),平台为 GPL16791。数据可用于探索 SRA 与 CTCF、H3K4me3、H3K27me3 的染色质结合特征,以及 SRA 对红系基因表达程序和红系标志物表达的影响,进而为红系发育与红白血病相关研究提供转录组层面的参考(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 06 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们报道了 lncRNA SRA 在人红白血病细胞系 K562 和源自 HSC 的原代人原红细胞中通过直接染色质结合调控全局基因表达的新功能。我们证明 SRA 与 CTCF、H3K4me3 和 H3K27me3 一起占据不同的基因组区域。此外,SRA 促进 K562 和原代人原红细胞中红系程序的转录组范围表达以及红系标志物的表达。因此,lncRNA SRA 在红系发育过程中的可能功能是促进红系基因的转录,从而促进红细胞生成。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL16791、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE151926

【使用注意】

· 源站最后修改于 Aug 31 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们报道了lncRNA SRA在人红白血病细胞系K562及源自HSCs的原代人原红细胞中,通过直接结合染色质调控全局基因表达的新功能。我们证明SRA与CTCF、H3K4me3及H3K27me3共同占据多种基因组区域。此外,SRA促进了K562细胞及原代人原红细胞中红系程序的全转录组表达及红系标志物的表达。因此,lncRNA SRA在红系发育中的可能功能是促进红系基因的转录,进而促进红细胞生成。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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