BAHCC1通过保守BAH模块将H3K27me3与基因沉默及肿瘤发生偶联[Jurkat细胞BAHCC1_H3Ac_ChIPseq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE151573

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数据说明

组蛋白H3第27位赖氨酸三甲基化（H3K27me3）调控转录抑制、细胞命运决定与分化。我们报道，一种先前未被表征的染色质调控因子BAHCC1所含的保守溴代邻近同源（BAH）模块能够特异性“识别”H3K27me3，并在哺乳动物细胞中强制沉默H3K27me3标记的基因。生化、结构及基于ChIP-seq的分析表明，BAHCC1对H3K27me3的直接“读取”是通过BAH结构域形成的疏水性三甲基赖氨酸结合“笼”实现的，该“笼”介导BAHCC1与H3K27me3标记基因的共定位。BAHCC1在人急性白血病中显著过表达，且在生化上，BAHCC1与抑制因子SAP30BP和HDAC相互作用。在急性白血病中，敲低BAHCC1或破坏BAHCC1 BAH介导的对H3K27me3的“读取”，会导致参与肿瘤抑制和细胞分化的H3K27me3靶基因去抑制，从而抑制肿瘤生长。在小鼠中，引入Bahcc1种系突变以破坏其与H3K27me3的结合会导致出生后致死，支持该通路在发育中的作用。

总体而言，本研究揭示了一种哺乳动物细胞中新颖的H3K27me3导向转导途径，该途径依赖于一个保守的BAH“阅读器”，其失调有助于肿瘤发生。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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