急性髓系白血病中CIITA甲基化调控HLA II表达的RRBS数据集

资源简介

急性髓系白血病中CIITA甲基化调控HLA II表达的RRBS数据集

GSE150371 是一个来自 NCBI 的甲基化谱分析数据集，全称为“Regulation of HLA II expression in acute myeloid leukemia by CIITA methylation (RRBS dataset)”，聚焦急性髓系白血病中 CIITA 甲基化对 HLA II 类基因表达的调控研究。该数据集采用高通量测序甲基化谱分析（RRBS）技术，研究对象为经去甲基化药物地西他滨和干扰素γ处理的急性髓系白血病细胞系，并涉及携带对照 sgRNA 或靶向 CIITA 的 sgRNA 的细胞。数据集由 Olli、Dufva 提交，发布时间为 2020 年 5 月 12 日，归类于肿瘤/白血病方向，共包含 1 个数据文件，样例文件为 GSE150371_series_matrix.txt.gz。

【数据集背景】

急性髓系白血病是血液系统恶性肿瘤，HLA II 类分子的表达状态与白血病细胞的免疫识别密切相关。CIITA 是 HLA II 类基因转录的关键调控因子，其启动子区域的 DNA 甲基化可能影响 CIITA 及下游 HLA II 类基因的表达。该数据集旨在通过 RRBS 技术考察地西他滨（一种去甲基化药物）和干扰素γ处理是否能够诱导 HLA II 类基因表达，并利用对照 sgRNA 与靶向 CIITA 的 sgRNA 细胞比较，以解析 CIITA 甲基化在其中的调控作用。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件，即 GSE150371_series_matrix.txt.gz，为 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件。数据主题标签包括“Methylation profiling by high throughput sequencing”、平台编号 GPL24676 以及物种编号 9606（人类）。数据内容对应 RRBS 甲基化谱分析结果，涉及经地西他滨和干扰素γ处理的急性髓系白血病细胞系，以及携带对照或 CIITA 靶向 sgRNA 的细胞样本。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题与数据集英文名一致。作者为 Olli 和 Dufva，发布时间为 2020 年 5 月 12 日。源站描述说明，研究使用急性髓系白血病细胞系，经低甲基化药物地西他滨和干扰素γ处理，以探究这些处理是否诱导 HLA II 类基因表达；细胞携带对照或靶向 CIITA 的 sgRNA。其余采集细节源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于研究急性髓系白血病中 CIITA 甲基化与 HLA II 类基因表达调控的关系，可用于分析去甲基化药物和干扰素γ处理对甲基化谱的影响，以及比较对照 sgRNA 与 CIITA 靶向 sgRNA 细胞的甲基化差异。也可作为 RRBS 高通量测序甲基化数据分析流程的参考数据。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE150371_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。

【质量与限制】

数据集仅包含 1 个系列矩阵文件，样本数量、测序深度、甲基化位点覆盖度、重复数及质控指标等信息源站未提供。使用时应结合源站原始记录核实数据适用范围。

【引用与许可】

作者为 Olli 和 Dufva，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。许可信息源站未提供。