急性髓系白血病患者原始细胞与健康造血干祖细胞RNA测序数据

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE149237

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

伴有t(8;21)(q22;q22)染色体易位的急性髓系白血病(AML)是AML最常见的亚型之一，可产生AML1-ETO(AE)致癌融合基因。AML1-ETO的表达对于t(8;21) AML的白血病发生和维持至关重要。基因表达的转录后调控通常通过转录本3‘-非翻译区(UTR)介导。AML1-ETO利用ETO基因的3’UTR，而ETO基因在造血细胞中通常不表达。因此，通过3‘UTR调控AML1-ETO的机制是有吸引力的治疗靶点。在本研究中，我们探讨了通过3’UTR对AML1-ETO的调控。我们证明，在t(8;21)患者和细胞系中，AML1-ETO主要使用ETO 3‘UTR的3.7kb异构体。采用荧光素酶检测方法，我们鉴定出AML1-ETO 3’UTR中2.8至3.4kb之间的一个片段，该片段受到负调控，在抑制microRNA生物合成后表达增加，并包含一个推定的let-7 microRNA靶位点。我们证明let-7b通过该位点直接抑制AML1-ETO。

对癌症基因组图谱急性髓系白血病数据集的分析显示，t(8;21)急性髓系白血病中let-7b及let-7家族miRNA的表达显著低于其他急性髓系白血病。最后，我们证明let-7b-5p抑制t(8;21)急性髓系白血病细胞系的增殖，恢复AML1-ETO靶基因的表达，并促进分化。我们的发现确立了AML1-ETO为let-7b的靶基因，并提示基于let-7的治疗可能适用于t(8;21)急性髓系白血病。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。