白血病氨基酸应答通路转录调控因子数据集
该数据集来自 NCBI GEO(GSE145783),聚焦白血病中氨基酸应答通路的转录调控因子。通过 CRISPR/Cas9 遗传筛选发现 ZBTB1 是 T-ALL 细胞响应天冬酰胺剥夺的关键介导因子,并调控 ASNS 转录

基本信息
资源简介
白血病氨基酸应答通路转录调控因子数据集
Transcriptional regulators of the amino acid response pathway in leukemia
该数据集来自 NCBI GEO(GSE145783),聚焦白血病中氨基酸应答通路的转录调控因子。通过 CRISPR/Cas9 遗传筛选发现 ZBTB1 是 T-ALL 细胞响应天冬酰胺剥夺的关键介导因子,并调控 ASNS 转录。数据包含三种细胞系(WT Jurkat、ZBTB1 敲除 Jurkat、表达 ZBTB1 cDNA 的敲除 Jurkat)的 RNA-Seq、ChIP-Seq 和 ATAC-Seq 数据,可用于研究 ZBTB1 与 ATF4 对 ASNS 的转录调控及染色质可及性(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 23 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):基于 CRISPR/Cas9 的遗传筛选揭示 ZBTB1 是 T-ALL 细胞对天冬酰胺剥夺反应的关键介导因子。ZBTB1 调控 ASNS 的转录,ASNS 是 ATF4 的转录靶标。ZBTB1 缺失导致 ASNS 转录和表达下降。ChIP-Sequencing 显示 ATF4 和 ZBTB1 均富集于 ASNS 启动子。该数据集包含三种不同细胞系(WT Jurkat 细胞、ZBTB1 敲除 Jurkat 细胞和表达 ZBTB1 cDNA 的 ZBTB1 敲除 Jurkat 细胞)的 RNA-Seq、ChIP-Seq 和 ATAC-Seq 数据,以支持这些发现。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL11154、9606。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE145783
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 02 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
基于CRISPR/Cas9的遗传筛选揭示,ZBTB1是T-ALL细胞对天冬酰胺剥夺反应的关键介导因子。ZBTB1调控ASNS的转录,而ASNS是ATF4的转录靶标。ZBTB1缺失导致ASNS转录和表达下降。ChIP-Sequencing显示ATF4和ZBTB1均富集于ASNS启动子区域。该数据集包含三种不同细胞系(野生型Jurkat细胞、ZBTB1敲除Jurkat细胞及表达ZBTB1 cDNA的ZBTB1敲除Jurkat细胞)的RNA-Seq、ChIP-Seq和ATAC-Seq数据,以支持上述发现。
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