10例慢性淋巴细胞白血病患者连续两个时间点DNA甲基化谱数据集

该数据集来自NCBI GEO,包含10例慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者连续两个时间点的DNA甲基化谱,采用genome tiling array平台(GPL13534)检测

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基因组分类GPL135349606
GSE143411: A dataset of sequential DNA methylation profiles (2 timepoints) of 10 patients with chronic lymphocytic leukemia

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

10例慢性淋巴细胞白血病患者连续两个时间点DNA甲基化谱数据集

A dataset of sequential DNA methylation profiles (2 timepoints) of 10 patients with chronic lymphocytic leukemia

该数据集来自NCBI GEO,包含10例慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者连续两个时间点的DNA甲基化谱,采用genome tiling array平台(GPL13534)检测。研究旨在探索表观遗传进化与不同疾病进程的关联。数据可用于分析CLL进展中的甲基化变化模式,比较未治疗、复发和难治患者之间的表观遗传差异,为理解克隆演化提供表观遗传层面的信息(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jan 10 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):克隆和亚克隆进化参与慢性淋巴细胞白血病(CLL)的进展。进化不仅选择遗传突变,也选择表观遗传状态。在此,我们对CLL患者进行了长期纵向DNA甲基化谱研究,以寻找表观遗传进化与不同疾病进程的关联。与遗传数据一致,在评估的长期未治疗(n = 3)和复发(n = 2)患者中未出现大规模甲基化进化,这些患者显示线性类型的克隆变化,而5例难治患者中有3例表现出DNA甲基化的深刻变化。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL13534、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE143411

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 13 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

克隆和亚克隆进化参与慢性淋巴细胞白血病(CLL)的进展。进化不仅选择基因突变,还选择表观遗传状态。在此,我们对CLL患者进行了长期纵向DNA甲基化谱分析研究,以寻找表观遗传进化与不同疾病进程之间的关联。与遗传数据一致,在所有评估的长期未治疗(n = 3)和复发(n = 2)患者中,均未出现大规模甲基化进化,这些患者显示出线性类型的克隆变化,而在检查的5名难治性患者中,有3名表现出DNA甲基化的深刻变化。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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