静息白血病细胞中AU-rich元件与TTP介导化疗耐药转录后程序
该数据集来自NCBI GEO,标题为静息白血病细胞中AU-rich元件与TTP介导化疗耐药的转录后程序,属于肿瘤/白血病分类

基本信息
资源简介
静息白血病细胞中AU-rich元件与TTP介导化疗耐药转录后程序
GSE141332 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达数据集,标题为“A post-transcriptional program of chemoresistance by AU-rich elements and TTP in quiescent leukemic cells”,中文可译为“静息白血病细胞中 AU-rich 元件与 TTP 介导化疗耐药的转录后程序”。该数据集归属于肿瘤/白血病分类,围绕白血病细胞在静息状态下通过转录后调控机制产生化疗耐药这一主题展开。数据集以 SuperSeries 形式组织,由若干子系列构成,当前提供的文件为一份系列矩阵文件,采用 GZIP 压缩格式。该数据集适合关注白血病化疗耐药机制、转录后调控以及基因表达谱分析的研究者参考使用,可通过下载系列矩阵文件获取表达数据并在本地开展分析。
【数据集背景】
该数据集聚焦于静息白血病细胞中的化疗耐药问题。根据源站标题,其研究主题是 AU-rich 元件(AU-rich elements)与 TTP 在静息白血病细胞中所构成的转录后程序如何参与化疗耐药。这一主题属于肿瘤学中白血病研究方向,涉及基因表达调控与药物耐受机制的交汇领域。数据集由 NCBI GEO 收录,作者为 Shobha 与 Vasudevan,发布时间标注为 Dec 03 201(原文如此)。源站将其描述为一个 SuperSeries,由下方列出的若干 SubSeries 组成,说明该数据集在 GEO 中承担着整合多个子系列的角色,便于围绕同一研究主题集中检索与获取数据。
【数据内容】
数据集当前提供的文件数量为 1,文件样例为 GSE141332_series_matrix.txt.gz,即一个经 GZIP 压缩的系列矩阵文本文件。系列矩阵文件通常用于承载样本层面的表达数据及其相关注释信息,是该数据集对外提供的主要数据载体。主题标签显示该数据集采用 Expression profiling by array(基于芯片的表达谱分析)技术路线,涉及平台编号 GPL16570,物种编号为 9606(即人类)。这些信息表明数据来源于人类样本的芯片表达谱检测。关于矩阵文件中具体包含的样本数量、基因数量、分组设计及临床信息等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI GEO(ncbi.nlm.nih.gov),属于公开的基因表达数据库资源。源站描述仅说明其为由若干 SubSeries 组成的 SuperSeries,未提供样本采集地点、采集时间、实验处理条件、伦理审批信息或具体实验流程等细节,因此这些内容源站未提供。数据集的作者信息为 Shobha 与 Vasudevan,发布时间标注为 Dec 03 201。数据以系列矩阵文件形式对外发布,用户可通过 GEO 的常规下载途径获取。
【适用场景】
基于其主题与技术类型,该数据集可用于白血病化疗耐药相关机制研究中的表达谱数据参考,例如围绕静息白血病细胞中转录后调控程序的分析、AU-rich 元件与 TTP 相关基因表达变化的探索,以及芯片表达谱数据的整合分析等。由于数据集以 SuperSeries 形式组织,也适合作为检索同一研究主题下多个子系列的入口。需要说明的是,具体可支持的统计分析方法与结论方向取决于数据文件中的实际内容,源站未提供相关说明。
【使用方法】
使用该数据集时,可先下载数据文件 GSE141332_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包,需先解压再按文本格式读取。建议先在小样本上核对字段结构、编码方式与注释信息,确认读取无误后再批量接入完整数据,以避免因格式或编码问题导致分析偏差。读取后可结合平台编号 GPL16570 对应的注释信息进行基因映射。关于具体的分析流程与参数设置,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集当前仅提供 1 个文件,即系列矩阵文件,未提供原始数据文件或其他辅助文件,源站亦未提供数据质量评估、缺失值情况、批次效应说明或数据校验信息,因此相关质量细节源站未提供。此外,发布时间标注为“Dec 03 201”,年份信息不完整,源站未提供更明确的说明。使用者在分析前应自行核查数据完整性与适用性。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Shobha 与 Vasudevan,来源于 NCBI GEO。关于数据的使用许可、引用格式要求及版权声明,源站未提供,使用者在引用或再分发前应自行查阅源站的相关政策与说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE141332
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.
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