慢性淋巴细胞白血病化疗反应差异的DNA甲基化数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE136724

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

慢性淋巴细胞白血病(CLL)对化疗的获得性耐药是一个重要的临床问题，通常由影响ATM-p53 DNA损伤反应通路或其他通路的细胞遗传学异常或基因突变引起。然而，也存在许多未检测到突变的耐药病例，我们决定探究DNA甲基化水平上的特定表观遗传变化是否可能是CLL耐药性发展的基础。我们使用Illumina Infinium HumanMethylation450 BeadChips芯片获取了71例对化疗反应不同的CLL患者的DNA甲基化谱。51例患者是CLL2O临床试验的受试者，其中36例在接受含氟达拉滨或苯达莫司汀方案治疗后被归类为复发/难治，而其余15例患者以及另外20例未参加试验的患者在采样时未经治疗。

尽管我们无法将化疗耐药与表观遗传变化相关联，但我们相信该数据集具有价值，可供研究人员用于检验其他假设，特别是鉴于患者在多种预后和分子标志物（IGHV突变状态、染色体异常、TP53突变状态等）方面已得到充分表征。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。