CD19内含子2保留导致CD19亚克隆移码突变白血病CART-19耐药

该数据集来自NCBI GEO(GSE136068),聚焦CD19内含子2保留在CART-19治疗后复发白血病中的作用。源站描述指出,内含子2保留影响CD19表达,且发生在全长CD19转录本背景下,通过Oxford Nanopore测序技术发现;对Reh白血病细胞系进行Direct RNA测序显示,内

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基因组预测GPL241069606
GSE136068: Retention of CD19 intron 2 contributes to CART-19 resistance in leukemias with subclonal frameshift mutations in CD19

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

CD19内含子2保留导致CD19亚克隆移码突变白血病CART-19耐药

Retention of CD19 intron 2 contributes to CART-19 resistance in leukemias with subclonal frameshift mutations in CD19

该数据集来自NCBI GEO(GSE136068),聚焦CD19内含子2保留在CART-19治疗后复发白血病中的作用。源站描述指出,内含子2保留影响CD19表达,且发生在全长CD19转录本背景下,通过Oxford Nanopore测序技术发现;对Reh白血病细胞系进行Direct RNA测序显示,内含子2保留在功能上等同于无义突变。数据包含1个文件(GSE136068_series_matrix.txt.gz),主题为高通量测序表达谱,物种为人(9606),平台为GPL24106。可用于研究CD19亚克隆移码突变与CART-19耐药机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 20 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们报告,影响CART-19复发白血病中CD19表达的内含子2保留,在使用Oxford Nanopore测序技术时发生于全长CD19转录本的背景下。通过对Reh白血病细胞系进行Direct RNA测序,我们表明内含子2保留在功能上等同于无义突变。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24106、9606。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE136068

【使用注意】

· 源站最后修改于 Nov 01 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE136068

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们报告,利用牛津纳米孔测序技术发现,在CD19全长转录本的情境下,影响CART-19治疗后复发白血病中CD19表达的intron 2保留现象确实存在。通过对Reh白血病细胞系进行直接RNA测序,我们证明intron 2的保留在功能上等同于无义突变。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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