B细胞急性淋巴细胞白血病免疫微环境演化小鼠数据集

资源简介

B细胞急性淋巴细胞白血病免疫微环境演化小鼠数据集

GSE134758 是一个来自 NCBI GEO 的单细胞转录组数据集，全称为“The Evolving Immune Microenvironment of B-cell Acute Lymphoblastic Leukemia [murine dataset]”，即“B 细胞急性淋巴细胞白血病免疫微环境的演化（小鼠数据集）”。该数据集聚焦肿瘤/白血病方向，通过对 B-ALL 受体小鼠以及两只健康同窝对照小鼠的骨髓和外周血单个核细胞（PBMCs）中的免疫群体进行单细胞 RNA-seq 分析，刻画白血病发生过程中免疫微环境的组成与变化。数据集由 Matthew T. Witkowski 提交，发布时间为 2019 年 7 月 23 日，主题标签涉及高通量测序表达谱分析，平台编号为 GPL24247，物种编号为 10090（小鼠）。数据集仅包含 1 个文件，即 GSE134758_series_matrix.txt.gz。

【数据集背景】

B 细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL）是起源于 B 系祖细胞的恶性血液肿瘤，其发生发展不仅取决于白血病细胞本身，也与骨髓及外周免疫微环境的相互作用密切相关。该数据集以小鼠为模型，比较 B-ALL 受体动物与健康同窝对照动物的免疫细胞群体，旨在从单细胞分辨率揭示白血病进程中免疫微环境的动态演化。数据集标题中的“Evolving”即强调免疫微环境随疾病进展而变化的特征，而“murine dataset”表明其研究对象为小鼠而非人类样本。

【数据内容】

数据集的核心内容是对小鼠骨髓和外周血单个核细胞（PBMCs）中的免疫群体进行单细胞 RNA-seq 分析。样本来源包括 B-ALL 受体动物以及两只健康同窝对照动物，通过对照设计可以比较白血病状态与健康状态下免疫细胞组成和转录特征的差异。数据以高通量测序表达谱的形式组织，主题标签涵盖“Expression profiling by high throughput sequencing”，平台为 GPL24247，物种为小鼠（10090）。数据集仅提供一个文件 GSE134758_series_matrix.txt.gz，属于 GEO 系列矩阵文件，通常用于汇总样本层面的表达信息。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI GEO（ncbi.nlm.nih.gov），源站标题与数据集英文名一致。样本采集自 B-ALL 受体小鼠及两只健康同窝对照小鼠的骨髓和外周血单个核细胞，随后对其中免疫群体开展单细胞 RNA-seq。数据由 Matthew T. Witkowski 提交，发布时间为 2019 年 7 月 23 日。除上述信息外，关于具体测序深度、细胞数量、建库方法等实验细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于白血病免疫微环境研究，尤其是需要在单细胞层面比较 B-ALL 与健康状态下骨髓及外周血免疫群体差异的场景。可用于免疫细胞亚群组成分析、疾病相关转录状态识别、对照比较研究，以及作为小鼠 B-ALL 单细胞转录组分析的参考数据。由于同时包含骨髓与 PBMCs 两类样本，也适合探讨局部骨髓微环境与外周循环免疫细胞之间的关系。具体分析目标应结合数据实际内容确定，源站未提供更细化的应用说明。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE134758_series_matrix.txt.gz，该文件为 GZIP 压缩包格式。建议先按文件格式解压并读取，在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。由于数据集仅包含一个系列矩阵文件，使用前应确认其内容与所需分析层面是否匹配；若需要原始测序数据或更细粒度的表达矩阵，源站未提供相关信息。

【质量与限制】

该数据集为小鼠模型数据，结论外推到人类 B-ALL 时需谨慎。样本包括 B-ALL 受体动物和两只健康同窝对照动物，对照数量有限，可能影响统计效力。数据集仅提供 1 个文件，且为系列矩阵汇总文件，可能不包含单细胞层面的完整原始信息。关于测序质量、细胞存活率、批次效应等质控指标，源站未提供。发布时间显示为“Jul 23 201”，年份信息不完整，引用时应以源站记录为准。

【引用与许可】

数据来源于 NCBI GEO，引用时应注明数据集编号 GSE134758 及作者 Matthew T. Witkowski。关于该数据集的具体许可条款与使用限制，源站未提供，使用前应查阅 NCBI GEO 的相关政策及源站页面说明。