急性髓系白血病谱系追踪揭示低甲基化药物对化疗耐药选择的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE134506

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

化疗耐药性癌症复发是导致死亡的主要原因。在急性髓系白血病（AML）中，化疗难治性复发源于白血病细胞中遗传、表观遗传和转录状态改变的复杂相互作用。我们开发了一个实验模型系统，利用体外谱系追踪结合外显子组、转录组和体内功能读数，以评估AML群体动态及支撑化疗耐药性发展的相关分子决定因素。我们发现，将标准化疗方案与低剂量DNA甲基转移酶抑制剂（DNMTi，去甲基化药物）联合使用可预防化疗耐药性复发。在机制上，DNMTi抑制了一组预先确定的具有干性特性的化疗耐药AML克隆的扩增，反而促进了较为罕见且适应性较差的化疗敏感克隆的扩增。重要的是，我们在异种移植模型和原代AML患者样本中均证实了DNMTi联合用药能够抑制干性依赖性化疗耐药性的发展。

总之，这些结果支持DNMTi联合治疗具有规避化疗耐药性AML复发发展的潜力。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。