BRD4抑制对白血病干细胞影响的微阵列数据集

源站描述显示,DNMT3A 的 Arg882 热点突变(DNMT3A-R882H)可与持续激活的 RAS 协同,在体外转化小鼠造血干/祖细胞并在体内诱导急性白血病,其机制涉及 DNA 低甲基化促进增强子/启动子激活

geo
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基因组分类Expression profiling by arrayGPL1740010090
GSE130634: Effect of BRD4 inhibition in leukemic stem cells (Microarray)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

BRD4抑制对白血病干细胞影响的微阵列数据集

Effect of BRD4 inhibition in leukemic stem cells (Microarray)

该数据集来自 NCBI GEO(GSE130634),聚焦 BRD4 抑制对白血病干细胞的影响,采用微阵列进行表达谱分析,物种为小鼠(10090),平台为 GPL17400,共含 1 个文件(GSE130634_series_matrix.txt.gz)。源站描述显示,DNMT3A 的 Arg882 热点突变(DNMT3A-R882H)可与持续激活的 RAS 协同,在体外转化小鼠造血干/祖细胞并在体内诱导急性白血病,其机制涉及 DNA 低甲基化促进增强子/启动子激活。数据可用于研究 BRD4 抑制下白血病干细胞的转录表达变化及相关分子机制(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 02 201。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):DNA 甲基转移酶 3A(DNMT3A)在多种造血系统恶性肿瘤中频繁突变。我们报道,DNMT3A 突变“热点”位于 Arg882(即 DNMT3A-R882H),其与持续激活的 RAS 协同,在体外转化小鼠造血干/祖细胞(HSPCs),并在体内诱导急性白血病。在机制上,DNMT3A-R882H 诱导的 DNA 低甲基化促进基因增强子/启动子激活。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:Expression profiling by array、GPL17400、10090。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE130634

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jun 14 201,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE130634

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  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DNA甲基转移酶3A(DNMT3A)在多种造血系统恶性肿瘤中频繁发生突变。我们报道,DNMT3A在Arg882处的突变“热点”(即DNMT3A-R882H)与组成性激活的RAS协同作用,在体外转化小鼠造血干/祖细胞(HSPCs),并在体内诱导急性白血病。机制上,DNMT3A-R882H诱导的DNA低甲基化促进了基因增强子/启动子的激活。在本数据集中,我们提供了微阵列数据,展示了BRD4抑制剂I-BET151对由DNMT3A R882H和NRAS G12D转化的白血病干细胞中基因表达的影响。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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