单细胞RNA测序、质谱流式与流式细胞术评估人骨髓 [scRNA]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE120221

标准获取流程：

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2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

单细胞分析的新技术促进了对造血过程和免疫系统的认识，但这些技术在多样本人类样本中交叉验证和可重复识别生物学变异的能力目前尚未得到证实。因此，我们对来自二十名年龄跨度较广的健康成年供者的人骨髓细胞进行了综合评估，同时采用单细胞RNA测序和多参数流式细胞术。这些数据刻画了健康供者之间的变异以及细胞群体频率随年龄相关的变化。技术的直接比较揭示了T淋巴细胞和自然杀伤细胞群体定量上的差异。使用质谱流式细胞术对免疫表型分型进行正交验证，显示与流式细胞术良好相关。使用单细胞RNA测序的技术重复匹配稳健，而生物学重复则显示变异。鉴于单细胞技术在转化研究中的使用日益增加，该资源可作为重要的参考数据集，并凸显了进一步优化的机会。

【资金来源】项目编号：1ZIAHL006163-05 联系PI/项目负责人：HOURIGAN, CHRISTOPHER 标题：急性髓系白血病（AML）复发的检测、预防与治疗。获奖机构：国家心肺血液研究所

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。