SRSF2 P95突变在骨髓增生异常中诱导RNA结合与剪接改变的转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE111900

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

剪接因子富含丝氨酸精氨酸剪接因子2（SRSF2）的突变发生于超过30%的骨髓增生异常（MDS）患者及一部分急性髓系白血病（AML）患者中，并预示不良预后。SRSF2广泛表达，并以序列和上下文依赖的方式指导外显子的包含或排除。SRSF2突变几乎 exclusively 影响RNA结合域C末端第95位的脯氨酸。我们在此通过RNA交联和免疫沉淀（HITS-CLIP）以及转录本水平的平行定量（RNA-seq），在全转录组范围内展示了SRSF2突变（P95H）如何在体内影响其正常功能，从而鉴定出差异结合和选择性剪接的SRSF2靶标。关键词：剪接，髓系肿瘤，SRSF2，HITS-CLIP

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。