T-PLL分子基础：TCL1/ATM及表观遗传指导的损伤反应可操作扰动 [小鼠SNP阵列]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE107510

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

T细胞幼淋巴细胞白血病（T-PLL）是一种罕见且预后不良的成熟T细胞恶性肿瘤。为完善其尚不完整的分子概念，我们整合了111例特征明确患者的基因表达改变、等位基因拷贝数（CN）及核苷酸序列的大规模图谱数据。除显著的T细胞活化特征和常见的克隆性变异外，我们还发现了拷贝数变异性、融合分子、替代转录本及进展相关动态的新热点。T-PLL的整体病变谱主要定位于DNA损伤应答、T细胞受体/细胞因子信号传导及组蛋白调控轴。我们构建了一个以TCL1过表达与损伤性ATM异常独特组合作为起始核心病变的T-PLL多维度发病模型。TCL1所施加的效应与受损的ATM协同作用，促成DNA损伤处理受损的白血病表型。功能失调的ATM似乎无法有效缓解升高的氧化还原负荷和端粒磨损，也难以引发针对基因毒性损伤的p53依赖性凋亡反应。

作为非基因毒性策略，p53再激活剂与去乙酰化酶抑制剂的协同组合能够恢复这种细胞死亡的执行。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。