糖皮质激素诱导急性淋巴细胞白血病转录调控数据集

该数据集来自 ebi.ac.uk,属于肿瘤/白血病分类,聚焦糖皮质激素诱导的急性淋巴细胞白血病转录调控。源站描述显示,研究对 SUP-B15、JURKAT、MOLT-3 和 CCRF-CEM 四株急性淋巴细胞白血病细胞系使用地塞米松和泼尼松龙等糖皮质激素处理六小时后提取 RNA,并采用单色微阵列进行

biostudies
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基因组分类Cell line - One-color microarraytranscription profiling by arrayHomo sapiens
Glucocorticoids induced transcriptional regulation in acute lymphoblastic leukemia

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

糖皮质激素诱导急性淋巴细胞白血病转录调控数据集

该数据集英文名为 Glucocorticoids induced transcriptional regulation in acute lymphoblastic leukemia,属于肿瘤/白血病分类,来源于 ebi.ac.uk。数据集聚焦糖皮质激素诱导的急性淋巴细胞白血病转录调控研究,对 SUP-B15、JURKAT、MOLT-3 和 CCRF-CEM 四株急性淋巴细胞白血病细胞系使用地塞米松和泼尼松龙等糖皮质激素处理六小时后提取 RNA,并采用单色微阵列进行转录谱分析。主题标签涵盖 Cell line - One-color microarray、transcription profiling by array 与 Homo sapiens,表明数据面向人类细胞系的单色微阵列转录组检测,可用于观察糖皮质激素短期作用下的基因表达变化。

【数据集背景】

急性淋巴细胞白血病是白血病中的一类重要疾病,糖皮质激素(如地塞米松和泼尼松龙)是相关研究和临床实践中常用的药物类别。该数据集围绕糖皮质激素处理后的转录调控展开,选择四株急性淋巴细胞白血病细胞系作为研究对象,旨在通过转录谱层面的检测反映药物作用下的基因表达响应。数据集归入肿瘤/白血病分类,主题标签明确指向人类(Homo sapiens)细胞系的单色微阵列转录谱分析,体现了以细胞系模型研究白血病转录调控的定位。

【数据内容】

数据集的内容为糖皮质激素诱导的急性淋巴细胞白血病细胞系转录谱数据。研究对象包括 SUP-B15、JURKAT、MOLT-3 和 CCRF-CEM 四株细胞系;处理因素为地塞米松和泼尼松龙等糖皮质激素;处理时长为六小时,随后提取 RNA。检测方式为单色微阵列(One-color microarray),数据类型属于 transcription profiling by array。主题标签同时标注了 Cell line 与 Homo sapiens,说明数据以人类细胞系为样本来源。除上述信息外,源站未提供关于样本数量、基因数量、具体表达矩阵内容等更细化的描述。

【采集与来源】

数据来源于 ebi.ac.uk。根据源站描述,实验流程为:对 SUP-B15、JURKAT、MOLT-3 和 CCRF-CEM 细胞系给予地塞米松和泼尼松龙等糖皮质激素处理,处理六小时后提取 RNA,并采用单色微阵列进行转录谱检测。该描述明确了细胞系、处理药物类别、处理时长与检测平台类型四项关键信息。关于实验批次、重复设置、RNA 提取与杂交的具体操作细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与糖皮质激素诱导的急性淋巴细胞白血病转录调控相关的研究场景,例如比较四株白血病细胞系在糖皮质激素处理六小时后的转录谱变化,观察地塞米松和泼尼松龙等药物作用下的基因表达响应,以及围绕单色微阵列转录谱数据开展的分析与验证。其肿瘤/白血病分类与人类细胞系属性,也使其可用于白血病细胞系模型层面的转录组研究参考。具体应用方向需结合数据实际内容判断,源站未提供进一步说明。

【使用方法】

使用时可按细胞系(SUP-B15、JURKAT、MOLT-3、CCRF-CEM)、处理药物(地塞米松、泼尼松龙等糖皮质激素)与处理时长(六小时)组织样本分组,并基于单色微阵列转录谱数据进行表达比较分析。由于数据属于 transcription profiling by array 类型,分析可围绕微阵列表达值展开。关于数据文件格式、归一化方式与配套分析工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于四株细胞系、六小时处理与单色微阵列检测,信息覆盖细胞系、药物类别、处理时长与平台类型。其限制在于:源站描述未提供重复数量、统计功效、表达数据的具体规模与质控指标,也未说明不同药物与细胞系组合的完整实验设计细节。因此在使用时对结论的推广需谨慎,相关质量评估信息源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源站为 ebi.ac.uk。关于引用方式与许可条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-MTAB-9250

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

" “Jurkat-P1.CEL” OR “Jurkat-P2.CEL” OR “Jurkat-P3.CEL” “MOLT-3-P1.CEL” OR “MOLT-3-P2.CEL” OR “MOLT-3-P3.CEL” “SUP-B15-P1.CEL” OR “SUP-B15-P2.CEL” OR “SUP-B15-P3.CEL” childhood B acute lymphoblastic leukemia adult T acute lymphoblastic leukemia childhood T acute lymphoblastic leukemia blood bone marrow 9

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