急性淋巴细胞白血病中MEF2D复发性融合的基因组分析

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00001001952

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

染色体易位是急性淋巴细胞白血病（ALL）的起始事件。本研究通过对560例ALL病例进行RNA测序（RNAseq），在22例具有独特基因表达谱的B祖细胞ALL（B-ALL）病例中鉴定出MEF2D（肌细胞增强因子2D）与五个基因（BCL9、CSF1R、DAZAP1、HNRNPUL1和SS18）之间的易位，其中最常见的是MEF2D-BCL9。对扩展至1164例B-ALL病例的队列分析，鉴定出30例存在MEF2D易位的病例，其中包括另一个融合伴侣FOXJ2，因此MEF2D易位病例占缺乏反复性遗传改变病例的5.3%。MEF2D易位型ALL具有独特的免疫表型、易位位点的DNA拷贝数改变、较大的诊断年龄以及不良预后等特征。这些易位导致MEF2D转录活性增强、淋巴系转化、HDAC9表达激活，并对组蛋白去乙酰化酶抑制剂治疗敏感。因此，MEF2D易位型ALL代表一种独特的高危白血病类型，应考虑新的治疗策略。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。