人白血病细胞系中ZFX结合的基因组范围图谱

该数据集来自ebi.ac.uk,提供人白血病细胞系中转录因子ZFX结合的基因组范围图谱,属于肿瘤/白血病分类,主题标签为ChIP-seq与Homo sapiens

biostudies
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基因组预测ChIP-seqHomo sapiens
Genome wide maps of ZFX binding in human leukemia cell lines

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

人白血病细胞系中ZFX结合的基因组范围图谱

Genome wide maps of ZFX binding in human leukemia cell lines

该数据集来自ebi.ac.uk,提供人白血病细胞系中转录因子ZFX结合的基因组范围图谱,属于肿瘤/白血病分类,主题标签为ChIP-seq与Homo sapiens。源站描述指出,Zfx对MLL-AF9融合所致实验性AML及Notch1激活所致T-ALL的发展与增殖是必需的,Zfx激活祖细胞相关基因表达程序并阻止分化,关键靶基因包括线粒体酶Ptpmt1和Idh2。该数据可用于研究急性白血病细胞起源特征的共同调控机制(来源 BioStudies)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):急性髓系白血病(AML)和急性T淋巴细胞白血病(T-ALL)维持其各自起源细胞——造血干/祖细胞和未成熟胸腺细胞——的未分化表型和增殖能力。维持这些祖细胞样特征的机制尚不清楚。我们报告,转录因子Zfx是MLL-AF9融合引起的实验性AML以及Notch1激活引起的T-ALL的发展和传播所必需的。在两种白血病类型中,Zfx激活祖细胞相关基因表达程序并阻止分化。关键的Zfx靶基因包括线粒体酶Ptpmt1和Idh2,其过表达部分挽救了Zfx缺陷型AML的传播。这些研究确定了一种控制源自不同谱系的急性白血病细胞起源特征的共同机制。

【主题与分类】

主题标签:ChIP-seq、Homo sapiens。本站分类:肿瘤/白血病。

【获取与许可】

源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-43147

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

E-GEOD-43147 人类白血病细胞系中ZFX结合的全基因组图谱 ChIP-seq EFO EFO_0002692 人类 急性髓系白血病(AML)和急性T淋巴细胞白血病(T-ALL)维持其各自起源细胞的未分化表型和增殖能力

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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