儿童骨髓增生异常综合征基因表达谱:亚型特征与向急性髓系白血病进展时间

该数据集为儿童骨髓增生异常综合征(MDS)的基因表达谱芯片数据,物种为Homo sapiens。数据覆盖不同亚组儿童MDS患者,可用于通过基因表达分析识别有意义的患者亚组,并考察与向急性髓系白血病(AML)进展相关的基因

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基因组分类transcription profiling by arrayHomo sapiens
Gene expression profiling of pediatric myelodysplastic syndrome (MDS) characterizes disease subtype and time to progression into acute myeloid leukemia (AML)

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

儿童骨髓增生异常综合征基因表达谱:亚型特征与向急性髓系白血病进展时间

该数据集为儿童骨髓增生异常综合征(MDS)的基因表达谱芯片数据,物种为Homo sapiens,来源于ebi.ac.uk。数据覆盖不同亚组的儿童MDS患者,可用于通过基因表达分析识别有意义的患者亚组,并考察与向急性髓系白血病(AML)进展相关的基因。数据集英文名称表明其关注儿童MDS的基因表达谱如何刻画疾病亚型以及进展为AML的时间。本站将其归类为肿瘤/白血病,主题标签为transcription profiling by array与Homo sapiens。整体而言,该数据集面向儿童MDS的分子分型与疾病进展研究,为识别不同风险或分类亚组之间的表达差异提供了芯片层面的转录组数据基础。

【数据集背景】

儿童骨髓增生异常综合征(MDS)是一组异质性较强的骨髓疾病,不同患者的疾病亚型与进展风险存在差异。源站描述指出,该数据集的目标是通过基因表达分析在儿童MDS患者中识别相关亚组,并找出参与向急性髓系白血病(AML)进展的基因。数据集英文名称进一步表明,其关注儿童MDS的基因表达谱对疾病亚型的刻画以及进展为AML的时间。这些信息共同说明该数据集服务于儿童MDS分子层面的亚组识别与进展机制研究。

【数据内容】

该数据集属于转录组表达谱芯片数据(transcription profiling by array),物种为Homo sapiens。数据覆盖不同亚组的儿童MDS患者,源站描述提到在不同亚组之间进行比较,涉及风险类别(class risk)与分类亚型(classification subtype)。数据集可用于通过基因表达分析识别有意义的患者亚组,并考察与向AML进展相关的基因。除上述内容外,样本数量、芯片平台型号、基因数量、具体亚组划分标准等细节源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于ebi.ac.uk。源站描述说明其通过基因表达分析对儿童MDS患者进行亚组识别,并在不同亚组之间开展类别比较。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、具体实验流程与数据处理步骤,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于儿童MDS的基因表达谱研究,包括在不同风险类别与分类亚型之间进行比较、识别有意义的患者亚组,以及考察与向急性髓系白血病进展相关的基因。其主题标签表明其属于转录组芯片表达谱数据,可用于以Homo sapiens为对象的相关转录组分析场景。具体应用方向与适用范围以源站描述为准,源站未提供更多限定。

【使用方法】

该数据集为转录组表达谱芯片数据,使用时应围绕不同亚组儿童MDS患者之间的类别比较展开分析,关注风险类别与分类亚型之间的表达差异,并考察与向AML进展相关的基因。关于数据下载方式、文件格式、预处理与归一化方法、分析软件与参数设置,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为芯片转录组表达谱数据,覆盖不同亚组的儿童MDS患者,可用于亚组识别与进展相关基因的考察。关于样本量、数据完整性、批次效应、验证情况与质量控制指标,源站未提供。使用时应注意其结论受源站描述范围限制,具体亚组划分与比较设计以源站信息为准。

【引用与许可】

该数据集来源于ebi.ac.uk。关于引用方式、许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-29326

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

silvia bresolin; Silvia Bresolin; Geertruy te Kronnie (2012). Gene expression profiling of pediatric myelodysplastic syndrome (MDS) characterizes disease subtype and time to progression into acute myeloid leukemia (AML) [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-29326

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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