44例JMML患者与7例健康供体的基因表达谱（发现队列）

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-71449

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

幼年型粒单核细胞白血病（JMML）是一种非常罕见且侵袭性强的干细胞疾病，主要发生于幼儿。RAS激活构成致癌信号的核心组分。此外，四分之一的JMML患者白血病原始细胞呈现7号染色体单体（-7），而超过半数患者显示年龄校正的胎儿血红蛋白（HbF）水平升高。造血干细胞移植是目前的标准治疗方案，其无事件生存率为50%～60%，这表明亟需新的分子驱动治疗选择。我们利用82例患者样本的大系列基因表达谱分析，旨在理解JMML背后的分子生物学机制，并识别出一个此前未被认识的、以LIN28B高表达为特征的分子亚组。有趣的是，LIN28B过表达与较高的HbF水平显著相关，而-7患者很少显示LIN28B表达增强。这与LIN28B作为胎儿造血介导者的作用相一致，从而解释了-7患者极少被诊断为年龄校正HbF水平升高的观察结果背后的生物学机制。

此外，这一新的胎儿样JMML亚组表现出let-7 microRNA家族大多数成员水平降低，并显示出参与胎儿造血和干细胞自我更新的基因的特征性过表达。最后，在我们的JMML患者系列中，高LIN28B表达与不良临床结局相关，但并不独立于其他预后因素，如年龄和年龄校正的HbF水平。总之，我们确定LIN28B是JMML中一个新的胎儿样亚组核心的关键分子参与者。在发现队列中，使用Agilent对44例JMML患者和7例健康供者的基因表达进行了检测。验证队列包含38例患者和9例健康供者，使用Affymetrix进行检测。所有患者数据可见于补充表S1。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。