伴与不伴慢性GSI处理的T细胞急性淋巴细胞白血病细胞系基因表达谱
该数据集为T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）细胞系在伴与不伴慢性γ分泌酶抑制剂（GSI）处理条件下的基因表达谱，来源于ebi.ac.uk，采用转录组芯片检测，物种为Homo sapiens
基本信息
资源简介
伴与不伴慢性GSI处理的T细胞急性淋巴细胞白血病细胞系基因表达谱
Gene expression profiles of T-cell acute lymphoblastic leukemia cell lines with and without chronic GSI-treatment
该数据集为T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）细胞系在伴与不伴慢性γ分泌酶抑制剂（GSI）处理条件下的基因表达谱，来源于ebi.ac.uk，采用转录组芯片检测，物种为Homo sapiens。数据覆盖对Notch抑制产生耐药、可在GSI存在且Notch信号缺失下扩增的persister细胞，以及GSI敏感细胞，并涉及BRD4、MYC、BCL2等靶点及JQ1处理。可用于研究T-ALL对Notch抑制的耐药机制、表观遗传调控及潜在治疗靶点（来源 BioStudies）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们在此构建了T-ALL对Notch抑制的耐药模型，鉴定出在γ分泌酶抑制剂（GSI）存在且Notch信号缺失时易于扩增的“persister”细胞。稀有persister细胞已存在于naïve T-ALL群体中，且该表型的可逆性提示其由表观遗传机制介导。相对于GSI敏感细胞，persister细胞激活了不同的信号和基因表达程序，并表现出整体染色质压缩。一项shRNA筛选鉴定出若干染色质调控因子，其缺失优先损害persister细胞活力，包括乙酰化组蛋白阅读器BRD4。BRD4在persister细胞中上调，并结合T-ALL关键功能基因（包括MYC和BCL2）附近的增强子。用BRD4抑制剂JQ1处理persister细胞可下调这些靶点并诱导生长停滞。
【主题与分类】
主题标签：transcription profiling by array、Homo sapiens。本站分类：肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面：https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-54378
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数据说明
E-GEOD-54378 伴或不伴长期GSI处理的T细胞急性淋巴细胞白血病细胞系的基因表达谱，通过芯片进行转录谱分析 EFO EFO_0002768 人类 在此，我们构建了T-ALL对Notch抑制的耐药模型，识别出“持久存活”细胞。
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