儿童ALL对泼尼松龙体外敏感或耐药的基因表达数据

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-19143

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

尽管近几十年来儿童急性淋巴细胞白血病（ALL）的总体预后已大幅改善，但婴儿（<1岁）ALL患者的生存机会仍然很差。阻碍婴儿ALL成功治疗的一个主要障碍是白血病细胞对目前用于ALL治疗的多种药物具有耐药性，尤其是对泼尼松龙（或泼尼松）。因此，我们着手寻找婴儿（<1岁儿童）与非婴儿（>1岁儿童）ALL样本中对泼尼松龙耐药或敏感之间差异表达的基因。原代婴儿和非婴儿ALL样本的体外泼尼松龙反应通过4天细胞毒性（MTT）试验测定。根据LC50值（即对50%的白血病细胞致死的泼尼松龙浓度）将患者样本分为敏感或耐药。泼尼松龙敏感性定义为LC50值<0.1 μg/mL泼尼松龙，泼尼松龙耐药性定义为LC50值>150 μg/mL。体外泼尼松龙反应为中间值的样本被排除。

共选取25例婴儿（<1岁）和27例非婴儿（>1岁）ALL样本，用于RNA提取并在Affymetrix HU133A微阵列上进行杂交。所获得的基因表达特征用于识别泼尼松龙耐药与敏感患者之间差异表达的基因，以深入了解婴儿和非婴儿ALL中泼尼松龙耐药的潜在机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。