FusionState：儿童白血病融合伙伴留出转录组学数据、分析代码与图表

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5281/zenodo.23496587

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 20.1 MB。

数据说明

本研究档案提供统计结果、可重复性材料、分析代码和发表图件，用以支持FusionState——一个用于研究儿童急性白血病中融合伴侣间保守调控状态的转录组学框架。该研究利用经过统一处理的Open Pediatric Cancer (OpenPedCan) RNA测序和融合数据，通过伴侣留出分析评估了KMT2A、RUNX1和NUP98融合家族。KMT2A在五个符合条件的融合伴侣中表现出稳健的迁移性，具有保守的HOX/MEIS相关调控和谱系依赖性转录特征。一项独立的TARGET至PPTC队列留出评估显示，9例KMT2A重排ALL病例与20例对照之间实现了完全分离（AUC = 1.000）。这一回顾性结果不应被解读为前瞻性临床验证。该档案包括最终发表图件、图件数值源数据、补充统计表、基因水平和通路分析、稳健性结果、预设分析配置、可重复性脚本以及软件环境信息。

上游OpenPedCan表达矩阵和原始测序数据集不再分发。该资源支持科学透明度、可重复性以及对儿童白血病中融合相关转录程序的未来研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。