AlloHeme 风险检测预测 allo-HCT 后 AML/MDS 患者复发结局 (FORWARD)

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT07607327

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

适应症：AML（急性髓系白血病）、MDS（骨髓增生异常综合征）、CMML。AlloHeme是CareDx实验室开发的一种基于血液的监测检测，利用NGS技术结合专有算法，预测接受异基因造血干细胞移植（allo-HCT）后AML/MDS患者复发的可能性。该技术分析从供者和受者所有体染色体中选取的405个单核苷酸多态性（SNPs）。移植前从供者和/或受者获取DNA，以识别特定的供者和受者SNPs（基线样本）。移植后获取血液样本，并将其与基线样本图谱进行比较，利用专有定量方法和独特的双索引技术，在痕量水平优化受者DNA，从而精确计算血液样本中受者细胞的嵌合率百分比。该方法可实现高度准确且可重复的嵌合率测定，检测限低至0.02%。

AlloHeme检测采用一种专有算法，将这种多分析物纵向嵌合体数据与移植后时间点相结合，以预测AML/MDS患者在接受异基因造血干细胞移植（allo-HCT）后发生临床复发的可能性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。