小鼠T-ALL（Vav-tTA；TRE-GFP-shIkaros原代白血病ALL101）细胞Ikaros恢复后的表达谱分析[RNA-Seq]

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-54447

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

为探究Ikaros抑癌机制，我们利用可诱导RNAi技术在由其敲低驱动的T-ALL中动态恢复内源性Ikaros表达。这导致Notch1及相关靶标（包括Myc）的快速转录抑制，即使在携带类似60%人类T-ALL中所见的自发性激活Notch1突变（产生异常ICN1）的白血病中也是如此。Ikaros恢复导致Notch1野生型白血病的持续消退，而内源性或工程化ICN1表达则促进疾病快速复发，表明ICN1在T-ALL中功能上拮抗Ikaros。对从三只未处理和三只Dox处理3天的小鼠中分离的T-ALL（Vav-tTA;TRE-GFP-shIkaros原代白血病ALL101）细胞进行了RNA-seq。每个RNA样本进行了两次测序运行。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。