REACH 研究中慢性淋巴细胞白血病患者样本的表达数据

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-58211

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们评估了REACH研究中CLL患者可用的治疗前标本的全基因组表达，REACH是一项关于氟达拉滨和环磷酰胺FC或R-FC（在FC基础上加用利妥昔单抗）治疗复发性CLL的研究，旨在了解疾病异质性并探索可能预示或预测R-FC治疗获益的基因。REACH（NCT00090051）已在www.clinicaltrials.gov注册。该数据集支持Weisser等人撰写的论文《PTK2表达与慢性淋巴细胞白血病的免疫化疗结果》。分析了REACH试验入组患者中300份可用的治疗前标本。其他贡献者：REACH研究研究人员和患者。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。