正常核型急性髓系白血病患者与健康对照的人造血干细胞及祖细胞区室表达数据
该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/白血病分类下的转录组学数据。研究对正常核型急性髓系白血病患者及年龄匹配健康对照的骨髓样本进行多参数高速荧光激活细胞分选,分离表型长期造血干细胞、短期造血干细胞和定向粒-单核祖细胞,并测量各群体基因表达谱,与健康对照对应群体比较

基本信息
资源简介
正常核型急性髓系白血病患者与健康对照的人造血干细胞及祖细胞区室表达数据
该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/白血病分类下的转录组学数据。研究对正常核型急性髓系白血病患者及年龄匹配健康对照的骨髓样本进行多参数高速荧光激活细胞分选,分离表型长期造血干细胞、短期造血干细胞和定向粒-单核祖细胞,并测量各群体基因表达谱,与健康对照对应群体比较。数据可用于探索白血病干/祖细胞区室的转录差异及相关研究(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):我们应用了一种新方法,对来自正常核型急性髓系白血病(AML)患者的高度分选的多能干细胞和祖细胞群体进行平行转录分析。我们从单个患者中分离表型长期造血干细胞(LT-HSC)、短期造血干细胞(ST-HSC)和定向粒-单核祖细胞(GMP),测量各群体的基因表达谱,并与年龄匹配健康对照的表型对应群体进行比较。本研究使用正常核型AML患者和年龄匹配健康对照的骨髓样本。通过多参数高速荧光激活细胞分选(FACS)从CD34+富集骨髓中纯化造血干细胞和祖细胞区室,以分离LT-HSC(Lin-/CD34+/CD38-/CD90+)、ST-HSC(Lin-/CD34+/CD38-/CD90-)和GMP(Lin-/CD34+/CD38+/CD123+/CD45R+)。
【主题与分类】
主题标签:Transcriptomics。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-35008
下载信息
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数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-35008
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们采用了一种新颖的方法,对来自核型正常的急性髓系白血病(AML)患者及健康对照者的多个高度分选的干细胞和祖细胞群体进行平行转录分析。我们从每位患者中分离出表型长期造血干细胞(LT-HSC)、短期造血干细胞(ST-HSC)以及定向粒-单核系祖细胞(GMP),并检测了各群体的基因表达谱,同时与年龄匹配的健康对照者中相应的表型细胞进行了比较。本研究使用了核型正常的AML患者及年龄匹配的健康对照者的骨髓样本。通过多参数高速荧光激活细胞分选(FACS)从CD34+富集的骨髓中纯化造血干细胞和祖细胞区室,以分离LT-HSC(Lin-/CD34+/CD38-/CD90+)、ST-HSC(Lin-/CD34+/CD38-/CD90-)和GMP(Lin-/CD34+/CD38+/CD123+/CD45R+)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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