表观遗传学、维生素C与异常血细胞形成——低危髓系恶性肿瘤患者的维生素C研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT03682029

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数据说明

条件：骨髓增生异常综合征、慢性粒单核细胞白血病-1、血细胞减少。背景：近期研究表明，表观遗传调控因子的突变在老年人看似正常的造血过程以及髓系癌症患者（pts）中均较为常见。长期以来，人们认为DNA甲基化是一种永久性的沉默标记，但随着十十一易位（TET）酶的发现，人们逐渐认识到主动去甲基化过程确实存在。该过程的初始步骤由TET酶催化，然而这些酶在血液系统癌症中经常发生突变和甲基化。催化组蛋白去甲基化的Jumonji酶在血液系统癌症中也受到异常调控。维生素C（VitC）在20世纪30年代被确认为预防坏血病所必需的微量营养素。与植物和大多数动物不同，人类由于缺乏所需的L-古洛糖酸内酯氧化酶，无法从葡萄糖合成维生素C。因此，维生素C必须通过饮食摄入。近期研究认为维生素C是Fe(II)和2-酮戊二酸双加氧酶家族的重要辅因子。

这些包括TET酶，它们参与将5-甲基胞嘧啶（5-mC）转化为其氧化衍生物5-羟甲基胞嘧啶（5-hmC）、5-羧基胞嘧啶（5-caC）和5-甲酰胞嘧啶（5-fC），以及参与组蛋白去甲基化的Jumonji酶。因此，维生素C可能在调节DNA和组蛋白去甲基化中发挥重要作用。然而，发现超过80%的血液癌症患者严重缺乏维生素C。有趣的是，对研究人员最近进行的一项随机、安慰剂对照初步研究（NCT02877277）中纳入的20名参与者的分析显示，在接受阿扎胞苷治疗的MDS和CMML患者中，通过口服维生素C补充剂，其维生素C水平很容易升高至正常范围（未发表数据）。当已经服用维生素C补充剂的患者被转换为安慰剂时，维生素C水平迅速降至正常范围以下。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。