复发性儿童急性淋巴细胞白血病的表观遗传重编程

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-34880

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

逆转复发患者的基因表达特征可能恢复化疗敏感性。我们证明，组蛋白去乙酰化酶抑制剂伏立诺他不仅能重编程复发原始细胞的异常基因表达谱，而且在原代患者样本和白血病细胞系中先于化疗应用时具有协同作用。原代患者样本采集自纽约大学医学中心治疗的患者以及儿童肿瘤学组（COG）细胞库，从三个原代患者样本和三个B系白血病细胞系中分离RNA，这些样本分别经或未经伏立诺他处理24小时。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。