ErasmusMC 血液病间充质细胞样本数据集

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001002659

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

高度纯化的间充质细胞（CD45-/7AAD-/CD235a-/CD31-/CD271+/CD105+）前瞻性地通过FACS从10名健康供体（HDs）的骨髓样本中分离出来。此数据集作为基线对照，用于观察白血病前期病例（45例低危骨髓增生异常综合征、4例Shwachman-Diamond综合征和3例Diamond-Blackfan贫血患者）的基因表达谱（GEPs）与正常健康背景下观察到的基因表达模式之间的差异。通过差异表达和基因集富集分析，我们确定炎症信号通路在白血病前期病例的间充质细胞中比其健康对应物显著更为活跃。最后，通过对健康供体GEPs的统计建模，我们确定了哪些白血病前期病例具有显著更活跃的炎症信号，并展示了与生存统计数据的强烈关联。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。