ErasmusMC 低危骨髓增生异常综合征间充质细胞基因表达数据集

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001002658

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

从45例低危骨髓增生异常综合征(LRMDS)患者的骨髓标本中，前瞻性地通过FACS分离出高度纯化的间充质细胞(CD45-/7AAD-/CD235a-/CD31-/CD271+/CD105+)。为了识别炎症特征，将45例LRMDS的基因表达谱(GEPs)与同样从健康供者骨髓标本中获得的高度纯化间充质细胞的GEPs进行了比较。此外，通过将这45例LRMDS病例的GEPs与4例Shwachman-Diamond综合征和3例Diamond-Blackfan贫血病例的GEPs进行比较，确定了炎症特征的重叠，这两种疾病分别代表了具有白血病进展倾向和微环境区室紊乱的不同亚类先天性白血病前期综合征。最后，GEPs和基因表达特征被用于预后判断和白血病进展的预测。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。