PML/RARA 对前白血病早期早幼粒细胞与 PML/RARA-Flt3ITD 白血病早幼粒细胞转录组的影响
数据为小鼠细胞的转录谱分析，比较表达 PML/RARA 的早期早幼粒细胞阶段（4 周龄，前白血病状态）与通过 Flt3-ITD 逆转录病毒载体转导 PML/RARA 骨髓产生的完全爆发 PML/RARA 白血病的早幼粒细胞
基本信息
资源简介
PML/RARA 对前白血病早期早幼粒细胞与 PML/RARA-Flt3ITD 白血病早幼粒细胞转录组的影响
该数据集围绕小鼠细胞中 PML/RARA 表达所引发的转录组变化展开，重点比较两种不同疾病阶段的早幼粒细胞：一种是表达 PML/RARA 的早期早幼粒细胞，处于 4 周龄的前白血病状态；另一种是由 PML/RARA 骨髓经 Flt3-ITD 逆转录病毒载体转导后形成的完全爆发 PML/RARA 白血病的早幼粒细胞。数据集属于肿瘤/白血病研究领域，主题标签为 Transcriptomics，来源站为 omicsdi.org。整体来看，该数据集通过转录谱分析，为理解 PML/RARA 在前白血病阶段与白血病阶段之间的基因表达差异提供了数据基础，适用于白血病发生机制、转录调控以及相关肿瘤生物学研究。
【数据集背景】
该数据集聚焦于 PML/RARA 在白血病发生过程中的转录组影响。PML/RARA 是急性早幼粒细胞白血病中具有关键意义的融合基因，而 Flt3-ITD 是一种常见的协同突变。源站描述指出，该研究通过比较表达 PML/RARA 的早期早幼粒细胞与完全爆发的 PML/RARA 白血病早幼粒细胞，试图揭示从preleukemic状态向白血病状态转变时的转录组特征。数据集分类为肿瘤/白血病，主题标签为 Transcriptomics，说明其核心研究手段是转录组水平的分析。
【数据内容】
数据内容为小鼠细胞的转录谱分析，涉及两种条件：一是表达 PML/RARA 的早期早幼粒细胞阶段，对应 4 周龄的前白血病状态；二是完全爆发的 PML/RARA 白血病早幼粒细胞，该白血病由转导了 Flt3-ITD 逆转录病毒载体的 PML/RARA 骨髓产生。这是一个双条件实验，比较前白血病早期早幼粒细胞与白血病早幼粒细胞之间的转录组差异。源站未提供具体的基因数量、差异表达基因列表、样本重复数或测序平台等细节。
【采集与来源】
数据来源站为 omicsdi.org。根据源站描述，研究使用小鼠细胞，在早期早幼粒细胞阶段表达 PML/RARA，并在 4 周龄时处于前白血病状态；同时，通过将 Flt3-ITD 逆转录病毒载体转导至 PML/RARA 骨髓，产生完全爆发的 PML/RARA 白血病，并获取白血病早幼粒细胞。源站未提供样本采集的具体组织部位、小鼠品系、性别、饲养条件或伦理审批信息。
【适用场景】
该数据集适用于白血病发生机制研究，尤其是 PML/RARA 相关急性早幼粒细胞白血病的转录组分析。可用于比较前白血病阶段与白血病阶段之间的基因表达变化，探索 Flt3-ITD 在白血病进展中的协同作用，也可作为转录组学数据用于相关生物信息学分析，例如差异表达分析、通路富集分析或调控网络推断。此外，该数据集可能对肿瘤生物学、血液肿瘤模型研究以及早期干预策略的探索具有参考价值。源站未提供具体的适用分析工具或推荐流程。
【使用方法】
源站未提供具体的数据使用说明、文件格式、下载方式或预处理步骤。用户如需使用，应参考来源站 omicsdi.org 上的原始条目获取进一步信息。由于该数据集为双条件转录组实验，常规使用方式可能包括对前白血病与白血病样本进行表达量比较，但源站未提供标准操作流程或代码示例。
【质量与限制】
源站未提供质量评估信息，例如测序深度、覆盖度、重复性、批次效应或数据过滤标准。该数据集基于小鼠模型，其结果向人类临床转化的适用性需谨慎评估。此外，源站未提供样本量、统计方法或验证实验信息，因此无法判断数据的统计效力与可重复性。使用时应结合原始研究背景，并注意前白血病状态与白血病状态之间的比较可能受到 Flt3-ITD 转导过程本身的影响。
【引用与许可】
源站未提供引用格式、许可协议或数据使用条款。用户在使用该数据集时，应直接访问 omicsdi.org 上的对应条目，以获取准确的引用信息和许可要求。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-59431
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
表达PML/RARA的小鼠细胞在早期早幼粒细胞阶段（4周龄，白血病前期）以及通过用Flt3-ITD逆转录病毒载体转导PML/RARA骨髓所生成的全部爆发的PML/RARA白血病中的转录谱分析。双条件实验：白血病前期早期早幼粒细胞对比白血病性早幼粒细胞。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
