全基因组测序发现早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病的新复发突变和重排
该数据集来自ebi.ac.uk,聚焦早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病(ETP ALL)。研究对12名ETP ALL患儿的肿瘤与正常DNA进行全基因组测序,并通过测序和DNA拷贝数分析评估52例ETP与42例非ETP T-ALL样本中体细胞改变的频率

基本信息
资源简介
全基因组测序发现早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病的新复发突变和重排
Discovery of novel recurrent mutations and rearrangements in early T-cell precursor acute lymphoblastic leukemia by whole genome sequencing
该数据集来自ebi.ac.uk,聚焦早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病(ETP ALL)。研究对12名ETP ALL患儿的肿瘤与正常DNA进行全基因组测序,并通过测序和DNA拷贝数分析评估52例ETP与42例非ETP T-ALL样本中体细胞改变的频率。数据涵盖细胞因子受体和Ras信号通路激活突变、造血发育破坏及组蛋白修饰基因失活突变,并发现DNM2、ECT2L、RELN等新突变靶点及染色体易位。可用于探索ETP ALL的遗传基础、突变特征及潜在分类标志(来源 BioStudies)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病(ETP ALL)是一种遗传基础未知的侵袭性恶性肿瘤。我们对12名ETP ALL患儿的肿瘤和正常DNA进行了全基因组测序,并通过测序和DNA拷贝数分析评估了52例ETP和42例非ETP T-ALL样本中体细胞改变的频率。ETP ALL的特征是调节细胞因子受体和Ras信号通路的基因中激活突变频率高(67%的病例;NRAS、KRAS、FLT3、IL7R、JAK3、JAK1、SH2B3和BRAF);破坏造血发育的改变(58%;GATA3、ETV6、RUNX1、IKZF1、EP300);以及组蛋白修饰基因中的失活突变(48%;EZH2、EED、SUZ12、SETD2和EP300)。我们还确定了新的突变靶点,包括DNM2、ECT2L和RELN。12例ETP ALL病例中有10例存在染色体易位,其中一些易位复杂并导致
【主题与分类】
主题标签:transcription profiling by array、Homo sapiens。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-28703
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数据说明
E-GEOD-28703 通过全基因组测序和转录谱芯片分析发现早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病中的新型复发性突变和重排 EFO EFO_0002768 人类 早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病(ETP ALL)是一种侵袭性的
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