SCH79797与PAR1拮抗剂PAR通路基因表达芯片分析数据
该数据集来自 Harvard Dataverse，围绕 PAR 信号通路相关基因表达变化，采用含 84 个基因的 PAR 通路基因表达 panel，通过 RT² Profiler PCR Array 在 HEL 与 K562 两株人白血病细胞系中检测基因表达，涉及 Thrombin 等化合物处理
基本信息
资源简介
SCH79797与PAR1拮抗剂PAR通路基因表达芯片分析数据
该数据集题为“Data for PAR-pathway gene expression array analysis of SCH79797 and PAR1-antagonist”，由作者 Sözer, Selçuk 提交至 Harvard Dataverse，发布时间为 2026 年，主题标签为 Medicine, Health and Life Sciences，在本站归入肿瘤 / 白血病分类，来源站为 doi.org。数据集围绕 PAR 信号通路相关基因表达变化展开，采用含 84 个基因的 PAR 通路基因表达 panel，通过 RT² Profiler PCR Array 在 HEL 与 K562 两株人白血病细胞系中检测基因表达，并涉及 Thrombin 等化合物处理。整体而言，该数据集为研究 PAR 信号通路在白血病细胞中的转录响应提供了基因表达层面的实验数据基础，可供相关领域的科研人员参考与再利用。
【数据集背景】
PAR 信号通路是细胞响应凝血酶等蛋白酶刺激的重要信号转导途径，其相关基因表达变化在白血病等血液系统肿瘤研究中具有关注价值。该数据集正是针对这一背景，围绕 PAR 通路相关基因的表达变化开展检测，所用材料包括人红白血病细胞系 HEL 与人慢性髓性白血病细胞系 K562，并涉及 SCH79797、PAR1-antagonist 以及 Thrombin 等化合物处理条件。数据集标题明确指向 SCH79797 与 PAR1-antagonist 处理下的 PAR 通路基因表达阵列分析，说明其设计目的在于观察这些化合物对 PAR 信号通路相关基因转录水平的影响。
【数据内容】
数据集的核心内容是 PAR 通路基因表达 panel 的检测结果，该 panel 包含 84 个基因，采用 RT² Profiler PCR Array（PAHZ-159; Qiagen, Düsseldorf, Germany）进行分析。检测对象为 HEL 与 K562 两株人白血病细胞系在相关化合物处理下的基因表达变化。源站描述中提及的化合物包括 Thrombin（Sigma Aldrich, St. Louis, M），其余化合物信息在源站描述中未完整呈现。数据的具体文件组成、样本数量、分组结构以及表达值矩阵等细节，源站未提供。
【采集与来源】
实验采用 RT² Profiler PCR Array 进行基因表达检测。cDNA 由 60 ng 总 RNA 使用 RNeasy MicroPlus Kit（Qiagen, Düsseldorf, Germany）按制造商说明合成。基因表达通过基于 SYBR Green 的 qPCR 在 LightCycler 480 II（Roche Diagnostics, Indianapolis, IN, USA）上检测。细胞培养方面，人红白血病细胞系 HEL 培养于补充 10% 胎牛血清（FBS）和 1% 青霉素/链霉素（P/S，100 U/mL、100 μg/mL）的 RPMI 1640 培养基中；人慢性髓性白血病细胞系 K562 培养于补充 10% FBS 和 1% P/S 的 IMDM 培养基中。数据经 Harvard Dataverse 发布，来源站为 doi.org。
【适用场景】
该数据集适用于 PAR 信号通路相关基因表达研究，尤其是白血病细胞系中转录响应的比较分析。可用于考察 SCH79797、PAR1-antagonist 及 Thrombin 等处理条件下 PAR 通路基因表达谱的变化，也可作为 PAR 通路机制研究、白血病细胞信号转导研究中的参考数据。对于需要利用 84 基因 PAR 通路 panel 进行验证或对照分析的研究者，该数据集具有潜在参考价值。具体适用范围的进一步说明，源站未提供。
【使用方法】
使用者可依据 RT² Profiler PCR Array 的常规分析流程对基因表达数据进行解读，包括对 qPCR 检测结果进行归一化与相对定量分析，比较不同处理组间 PAR 通路相关基因的表达差异。由于数据集涉及 HEL 与 K562 两株细胞系及多种化合物处理，使用时应结合具体实验分组进行对应分析。数据文件的具体格式、字段说明与分析脚本等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于标准化的 RT² Profiler PCR Array 与 LightCycler 480 II 平台产生，实验材料与试剂信息在源站描述中有明确交代。但源站描述在化合物列表处出现截断，Thrombin 之后的化合物信息不完整；数据的具体样本量、重复次数、统计分析方法及原始数据质量评估等信息，源站未提供。此外，数据集仅涉及两株人白血病细胞系的体外实验，向其他细胞类型或体内情境的外推需谨慎。
【引用与许可】
作者为 Sözer, Selçuk，机构为 Harvard Dataverse，发布时间为 2026 年，来源站为 doi.org。数据集的许可条款、引用格式及使用限制等具体信息，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://doi.org/10.7910/DVN/US3VJI
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 15.8 KB。
数据说明
采用包含84个基因的PAR通路基因表达面板，通过RT² Profiler PCR Array（PAHZ-159；Qiagen，德国杜塞尔多夫）分析检测了与PAR信号通路相关的基因表达变化。-对于PCR阵列，使用RNeasy MicroPlus试剂盒（Qiagen，德国杜塞尔多夫）按照制造商说明从60 ng总RNA合成cDNA。使用基于SYBR Green的qPCR在LightCycler 480 II（Roche Diagnostics，美国印第安纳州印第安纳波利斯）上检测基因表达。人红白血病细胞系（HEL）培养于补充有10%胎牛血清（FBS）和1%青霉素/链霉素（P/S）（100 U/mL，100 μg/mL）的RPMI 1640培养基中。-人慢性髓性白血病细胞系（K562）培养于补充有10% FBS和1% P/S的IMDM中。-所用化合物包括凝血酶（Sigma Aldrich，美国密苏里州圣路易斯）、PAR1抑制剂Vorapaxar（SCH530348）和SCH79797（MedChemExpress，美国新泽西州蒙茅斯章克申）。
-各化合物的最佳孵育时长和浓度：在无血清条件下，HEL细胞分别用1 U凝血酶（1小时）、80 μM vorapaxar（1小时）、1 U凝血酶+80 μM vorapaxar（1小时）或0.5% DMSO（1小时）处理。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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