慢性淋巴细胞白血病基因组数据集
该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/白血病领域,英文名为 CLL Genome。慢性淋巴细胞白血病(CLL)基因组计划旨在识别与 CLL 发生发展相关的未知遗传变异,目标是在 500 个独立肿瘤中建立全面的遗传变异目录

基本信息
资源简介
慢性淋巴细胞白血病基因组数据集
该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/白血病领域,英文名为 CLL Genome。慢性淋巴细胞白血病(CLL)基因组计划旨在识别与 CLL 发生发展相关的未知遗传变异,目标是在 500 个独立肿瘤中建立全面的遗传变异目录。作为国际癌症基因组联盟(ICGC)成员,该计划致力于开发诊断工具、发现治疗靶点并制定个体化治疗策略。研究包含两个数据集,分别对应全基因组测序与外显子测序相关论文(来源 omicsdi.org)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):慢性淋巴细胞白血病(CLL)基因组计划旨在识别参与 CLL 发生和发展的遗传变异,这些变异目前仍属未知,目标是在 500 个独立肿瘤中生成一份全面的遗传变异目录。CLL 基因组计划作为国际癌症基因组联盟(ICGC)的贡献成员,其目的是创建诊断工具、发现治疗靶点并开发新策略,从而实现 CLL 的定制化治疗,使其更加精准和有效。本研究包含两个数据集。EGAD00001000023 在 Nature 论文(2011)中描述,即 Whole-genome sequencing identifies recurrent mutations in chronic lymphocytic leukaemia;数据集 EGA00001000044 & & EGAD00001000083 在 Nature(2011)论文中描述,即 Exome sequencing identifies recurrent mutati
【主题与分类】
主题标签:Genomics。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAS00000000092
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
慢性淋巴细胞白血病(CLL)基因组计划旨在识别参与CLL发生与进展且目前仍未知的基因改变,目标是对500个独立肿瘤中的基因改变进行全面编目。作为国际癌症基因组联盟(ICGC)的贡献成员,CLL基因组计划旨在创建诊断工具、发现治疗靶点并开发新策略,以实现CLL的个体化治疗,使其更加精准和有效。本研究包含两个数据集。EGAD00001000023在《自然》(2011)论文《全基因组测序识别慢性淋巴细胞白血病中的复发性突变》中描述,数据集EGA00001000044 && EGAD00001000083在《自然》(2011)论文《外显子组测序识别慢性淋巴细胞白血病中剪接因子SF3B1基因的复发性突变》中描述。在ICGC-CLL基因组计划内生成的其他数据可在研究EGAS00001000374和EGAS00001001306中找到。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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