基于细胞信号分类器预测老年急性髓系白血病诱导治疗反应
该数据集来自 search.dataone.org,包含对55岁以上非M3型急性髓系白血病患者骨髓和外周血样本进行多参数流式细胞术分析所生成的单细胞网络谱(SCNP)数据

基本信息
资源简介
基于细胞信号分类器预测老年急性髓系白血病诱导治疗反应
Cell signaling-based classifier predicts response to induction therapy in elderly patients with acute myeloid leukemia
该数据集来自 search.dataone.org,包含对55岁以上非M3型急性髓系白血病患者骨髓和外周血样本进行多参数流式细胞术分析所生成的单细胞网络谱(SCNP)数据。数据覆盖细胞存活、分化和凋亡通路信号,用于训练和验证预测标准诱导化疗反应(完全缓解、完全缓解伴血液学不完全恢复或耐药)的诊断分类器。数据集包含来自四项SWOG AML试验的SCNP可评估患者,分为训练集和验证集,并开发了五个分类器在独立骨髓验证样本中测试预测准确性。可用于白血病治疗反应预测模型的构建与评估(来源 DataONE,CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication 许可)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):单细胞网络谱(SCNP)数据由对55岁以上非M3型急性髓系白血病患者的骨髓(BM)和外周血(PB)样本进行多参数流式细胞术分析生成,用于训练和验证一种诊断分类器(DXSCNP),以预测标准诱导化疗的反应(完全缓解[CR]或伴血液学不完全恢复的完全缓解[CRi] versus 耐药病[RD])。来自四项SWOG AML试验的SCNP可评估患者被随机分为训练集(N = 74例CR、CRi或RD患者;BM集 = 43;PB集 = 57)和验证分析集(N = 71;BM集 = 42,PB集 = 53)。细胞存活、分化和凋亡通路信号被用作DXSCNP的潜在输入。五个DXSCNP分类器在SWOG训练集上开发,并在独立的BM验证样本集(N =
【主题与分类】
主题标签:acute myeloblastic leukemia (AML)、single-cell network profiling (SCNP)、elderly patients、predictive classifier、signaling pathways。本站分类:肿瘤/白血病。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3Af61100d5b9562452fff6cea06ffff00cc9ae1e96e40e28d13c8128c46b1e75d5
使用许可:CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication。
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- OpenDataLab:
数据说明
单细胞网络谱分析(SCNP)数据源自对年龄>55岁的非M3型急性髓系白血病(AML)患者采集的骨髓(BM)和外周血(PB)样本进行多参数流式细胞术分析,用于训练和验证一种诊断分类器(DXSCNP),以预测对标准诱导化疗的反应(完全缓解[CR]或伴不完全血液学恢复的完全缓解[CRi] versus 耐药性疾病[RD])。来自四项SWOG AML试验的可评估SCNP的患者被随机分配至训练集(N=74例患者,含CR、CRi或RD;BM集=43;PB集=57)和验证分析集(N=71;BM集=42,PB集=53)。细胞存活、分化和凋亡通路信号被用作DXSCNP的潜在输入。在SWOG训练集上开发了五种DXSCNP分类器,并在来自ECOG AML试验的独立BM验证样本集(N=24)中测试预测准确性,以选择最终分类器,该分类器是CR/…的显著预测因子。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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