B细胞慢性淋巴细胞白血病CD3+ T细胞
该数据集来源于ebi.ac.uk,聚焦B细胞慢性淋巴细胞白血病(B-CLL)患者CD3+ T细胞的转录组分析。与多数癌症不同,B-CLL患者非恶性T细胞区室呈扩增状态

基本信息
资源简介
B细胞慢性淋巴细胞白血病CD3+ T细胞
该数据集聚焦于B细胞慢性淋巴细胞白血病(B-CLL)患者来源的CD3+ T细胞,通过转录组层面的分析来探索T细胞在该疾病中的角色。与许多其他类型癌症中非恶性T细胞区室受到抑制的情况不同,B-CLL患者的非恶性T细胞区室呈现扩增状态,这一特征使T细胞成为理解B-CLL免疫微环境的重要研究对象。数据集收录了来自B-CLL患者纯化T细胞与正常供者T细胞的微阵列分析结果,旨在识别差异表达基因。正常供者T细胞对照数据(n=8)此前已在GDS2908记录中发表。该数据集属于肿瘤/白血病分类,来源站为ebi.ac.uk,主题标签为transcription profiling by array与Homo sapiens。
【数据集背景】
B细胞慢性淋巴细胞白血病是一种以B细胞异常增殖为特征的血液系统肿瘤。在该疾病中,一个值得关注的现象是患者体内非恶性的T细胞区室并未像其他癌症中常见的那样被削弱,反而出现扩增。这一扩增状态提示T细胞可能在B-CLL的疾病进程中扮演某种角色,因此有必要从基因表达层面系统比较患者T细胞与正常T细胞的差异。该数据集正是围绕这一背景,对CD3+ T细胞进行转录组分析,以期为理解T细胞在B-CLL中的作用提供线索。
【数据内容】
数据集的核心内容是针对B-CLL患者CD3+ T细胞与正常供者T细胞的微阵列分析。研究对象为从B-CLL患者中分离纯化的T细胞,以及正常供者的T细胞。分析目的在于识别两组之间差异表达的基因。正常供者T细胞的对照数据共有8例,这些对照数据此前已在GDS2908记录中发表。数据集的主题标签包括transcription profiling by array和Homo sapiens,表明其采用微阵列技术进行人类转录组层面的检测。
【采集与来源】
该数据集的来源站为ebi.ac.uk。根据源站描述,研究分析了从B-CLL患者CD3+ T细胞中分离的T细胞。正常供者T细胞对照数据(n=8)为已发表数据,收录于GDS2908记录中。除上述信息外,关于具体的样本采集流程、时间范围、地理地点等细节,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究B-CLL中T细胞免疫生物学的研究者,尤其是关注非恶性T细胞区室扩增现象及其转录组特征的场景。通过比较B-CLL患者T细胞与正常供者T细胞的基因表达谱,可用于探索差异表达基因,进而为理解T细胞在B-CLL中的作用提供数据支持。此外,由于涉及肿瘤/白血病分类,该数据集也可用于白血病相关转录组分析的方法学参考或与其他B-CLL数据集的整合分析。
【使用方法】
该数据集以转录组微阵列数据形式提供,用户可通过来源站ebi.ac.uk获取。分析时可将B-CLL患者T细胞样本与正常供者T细胞对照(n=8,来自GDS2908记录)进行比较,以识别差异表达基因。具体的数据下载方式、文件格式、预处理步骤及分析工具,源站未提供。
【质量与限制】
正常供者T细胞对照数据(n=8)此前已在GDS2908记录中发表,说明该对照数据具有可追溯的发表来源。然而,关于样本量(除对照n=8外)、平台信息、数据质控指标、批次效应处理等质量相关信息,源站未提供。此外,该数据集仅涉及转录组层面的微阵列分析,不包含其他组学或功能验证信息,源站未提供相关说明。
【引用与许可】
该数据集的来源站为ebi.ac.uk。关于具体的引用要求、许可条款或使用限制,源站未提供。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://ebi.ac.uk/biostudies/studies/E-GEOD-19147
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
E-GEOD-19147 通过芯片对B细胞慢性淋巴细胞白血病的CD3+ T细胞进行转录谱分析 EFO EFO_0002768 智人 对从B细胞慢性淋巴细胞白血病(B-CLL)患者的CD3+ T细胞中分离出的T细胞进行分析。与其他类型的癌症相比,非恶性的T细胞
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