caArray_willm-00140:TARGET-ALL 表达数据:儿童肿瘤组高危儿童ALL研究9906
该数据集来自 omicsdi.org,属于肿瘤/白血病主题,聚焦儿童高危急性淋巴细胞白血病。数据基于 Affymetrix HG-U133_Plus_2 芯片,覆盖血液与骨髓组织,包含外周血与骨髓样本,疾病状态为儿童前体B淋巴母细胞白血病

基本信息
资源简介
caArray_willm-00140:TARGET-ALL 表达数据:儿童肿瘤组高危儿童ALL研究9906
caArray_willm-00140 数据集全称为 TARGET-ALL Expression: Children's Oncology Group Study 9906 for High-Risk Pediatric ALL,收录于 omicsdi.org,归类于肿瘤/白血病主题,聚焦儿童高危急性淋巴细胞白血病。该数据集采用 Affymetrix HG-U133_Plus_2 芯片开展基因表达检测,物种为人(Homo sapiens),组织来源覆盖血液与骨髓,材料类型包括外周血与骨髓样本,疾病状态为儿童前体B淋巴母细胞白血病,主题标签为转录组学。其原始研究关注微小残留病与无复发生存相关的基因表达分类器,旨在改善高危急性淋巴细胞白血病患儿的结局预测与风险分层。
【数据集背景】
该数据集来源于儿童肿瘤学组(Children's Oncology Group)开展的研究 9906,研究对象为高危儿童急性淋巴细胞白血病患者。源站描述所对应的研究主题为“微小残留病与无复发生存相关的基因表达分类器改善高危急性淋巴细胞白血病儿童的结局预测与风险分类”。这一背景表明,数据集所承载的表达谱数据服务于白血病风险分层与预后预测的研究方向,属于转录组学在儿童肿瘤领域的应用。
【数据内容】
数据集包含基因表达数据,检测平台为 Affymetrix HG-U133_Plus_2 芯片阵列。物种为人(Homo sapiens)。组织部位涉及血液与骨髓,材料类型包括外周血与骨髓样本。疾病状态为儿童前体B淋巴母细胞白血病。主题标签为转录组学。除上述内容外,样本数量、基因数量、具体分组与临床变量等信息源站未提供。
【采集与来源】
数据集来源站为 omicsdi.org,数据集标识为 caArray_willm-00140。检测平台为 Affymetrix HG-U133_Plus_2,检测类型为基因表达。样本取材自血液与骨髓,涵盖外周血与骨髓两种材料类型。研究依托儿童肿瘤学组 9906 研究开展。关于样本采集流程、时间跨度、中心数量等细节,源站未提供。
【适用场景】
基于其疾病背景与数据类型,该数据集适用于儿童高危急性淋巴细胞白血病相关的基因表达分析,例如围绕微小残留病与无复发生存开展表达谱层面的分类器构建与评估、风险分层研究,以及儿童前体B淋巴母细胞白血病的转录组学比较分析。具体分析用途应以源站描述的研究主题为限,其他应用场景源站未提供。
【使用方法】
源站未提供具体的使用方法说明,包括数据下载方式、文件格式、预处理流程与配套分析工具等。
【质量与限制】
源站未提供关于数据质量评估、缺失值情况、批次效应或样本代表性等方面的说明。使用时应注意到该数据集仅覆盖血液与骨髓来源的儿童前体B淋巴母细胞白血病样本,其适用范围受此疾病与材料类型限定。
【引用与许可】
源站未提供引用方式与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-GEOD-68735
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
基因表达分类器用于微小残留病和无复发生存可改善高危急性淋巴细胞白血病儿童的结果预测和风险分类:一项儿童肿瘤学组研究 willm-00140 检测类型:基因表达 提供者:Affymetrix 芯片设计:HG-U133_Plus_2 生物体:智人(ncbitax) 组织部位:血液、骨髓 材料类型:外周血、骨髓 疾病状态:儿童前体B淋巴细胞白血病
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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