慢性淋巴细胞白血病RNA测序数据集(59例样本)

该数据集来自omicsdi.org,包含59例慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者的Illumina RNA测序数据,其中57例为单端测序,2例为双端测序

omicsdi
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基因组分类Genomics
b3ecd683-a80d-4d54-aac7-cd82a208d2b7 - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

慢性淋巴细胞白血病RNA测序数据集(59例样本)

该数据集收录了59例慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者的Illumina RNA测序数据,属于肿瘤/白血病研究领域,主题标签为基因组学(Genomics)。数据来源于omicsdi.org,整体以转录组测序为核心,覆盖了CLL患者样本的RNA层面信息。在测序策略上,绝大多数样本采用单端测序,共57例;另有2例采用双端测序。这一构成使得该数据集既具备一定规模的样本量,又在测序方式上保留了少量差异,可为白血病相关转录组研究提供原始数据基础。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

慢性淋巴细胞白血病是一种以成熟B淋巴细胞克隆性增殖为特征的血液系统恶性肿瘤,其分子机制、基因表达特征及转录组变化一直是肿瘤基因组学研究的重点方向之一。RNA测序技术能够从整体转录本水平反映样本的基因表达情况,包括可变剪接、融合基因以及表达丰度差异等信息,因此被广泛用于白血病的基础研究与转化研究。该数据集正是在这一背景下产生,聚焦于CLL患者样本的RNA测序数据,主题标签为基因组学,所属分类为肿瘤/白血病,可为相关研究提供转录组层面的数据支持。

【数据内容】

该数据集包含59例慢性淋巴细胞白血病患者样本的Illumina RNA测序数据。从测序读长结构来看,57例样本为单端测序,2例样本为双端测序。数据以样本为单位组织,数据集英文名称为“b3ecd683-a80d-4d54-aac7-cd82a208d2b7 - samples”,表明其内容围绕样本层级展开。除上述样本数量、测序平台与测序方式外,源站未提供更多关于具体基因、表达矩阵、突变信息或临床注释的细节。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org。源站描述指出,这是一组针对59例慢性淋巴细胞白血病患者样本的Illumina RNA测序数据,其中57例为单端测序,2例为双端测序。关于样本采集地点、采集时间、患者纳入标准、伦理审批信息以及具体测序中心等,源站未提供。

【适用场景】

基于其数据构成,该数据集可适用于慢性淋巴细胞白血病相关的转录组分析场景,例如基因表达水平比较、样本间转录组差异探索,以及RNA测序数据处理流程的测试与验证。由于包含单端与双端两种测序方式,也可用于考察不同测序策略在数据处理中的兼容性。需要说明的是,具体适用场景受限于源站所提供的信息范围,源站未提供关于临床表型、治疗信息或验证实验的进一步说明。

【使用方法】

使用者可将该数据集作为RNA测序数据资源,按照Illumina RNA测序数据的常规处理流程进行质控、比对、转录本定量与表达分析。对于57例单端测序样本和2例双端测序样本,宜在分析前分别确认其读长结构,并在流程中作相应处理。关于数据下载方式、文件格式、参考基因组版本及配套分析工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集共包含59例CLL患者样本,其中57例为单端测序,2例为双端测序。样本测序方式不完全一致,可能对后续统一分析带来一定影响,使用时应予以关注。除样本数量、测序平台与测序方式外,源站未提供关于数据质量评分、覆盖深度、批次信息、临床元数据及验证结果等内容,因此无法对数据质量与适用范围作出进一步判断。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制及数据访问权限,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001008320

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This dataset includes Illumina RNA Sequencing Data for 59 chronic lymphocytic leukemia patient samples. 57 samples are single end, 2 samples are paired end sequencing.

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