肠道内抗菌药物耐药性的扩增与选择

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT02058888

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：急性白血病。全球范围内多重耐药（MDR）病原体发病率的上升令人担忧。抗菌治疗是分离出MDR病原体的一个风险因素，因此可能促成所观察到的趋势。迄今为止，尚未系统研究不同抗菌药物所致选择压力程度的差异。拟议项目的目的是利用宏基因组鸟枪法测序确定抗生素治疗对人体肠道微生物组中耐药基因拷贝数的影响。将在接受环丙沙星或复方磺胺甲噁唑单药治疗的患者临床队列中测定胃肠道中的耐药基因计数。随后对选择压力进行量化和比较，有助于应用选择耐药潜力较低的抗生素。为实现这一目标，将在德国感染研究中心的两个中心（图宾根、科隆）开展一项自身对照的前瞻性观察性流行病学研究。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。